99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1953 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1953  PASTA domain-containing protein  100 
 
 
560 aa  1098    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.86563 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0733  PASTA domain-containing protein  28.33 
 
 
541 aa  154  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0371  PASTA domain containing protein  30.16 
 
 
530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.383878  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  34.3 
 
 
651 aa  95.9  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  36.95 
 
 
582 aa  94.7  4e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.34 
 
 
584 aa  77.4  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.05 
 
 
645 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  29.22 
 
 
646 aa  75.1  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  22.93 
 
 
692 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2230  PASTA domain-containing protein  31.47 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.746907  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3480  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.64 
 
 
660 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.939542  normal  0.0353646 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  28.87 
 
 
618 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3077  serine/threonine protein kinase  35.58 
 
 
708 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2045  PASTA domain containing protein  23.81 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.29 
 
 
638 aa  67.4  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1041  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase:PASTA  30.3 
 
 
672 aa  67.4  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.513032  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1665  PASTA domain containing protein  26.61 
 
 
367 aa  65.1  0.000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000110071  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2392  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.53 
 
 
702 aa  64.3  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00165759  hitchhiker  0.000838349 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  25.59 
 
 
691 aa  63.5  0.000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.09 
 
 
652 aa  63.2  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.3 
 
 
635 aa  63.2  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.5 
 
 
667 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  28.93 
 
 
621 aa  63.2  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3066  serine/threonine protein kinase  26.64 
 
 
598 aa  63.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370725  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  23.96 
 
 
625 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5945  PASTA domain containing protein  29.94 
 
 
273 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.637805  normal  0.0723251 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  28.52 
 
 
615 aa  62  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.24 
 
 
658 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.86 
 
 
650 aa  61.6  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.26 
 
 
641 aa  61.2  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.16 
 
 
626 aa  60.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.37 
 
 
666 aa  60.5  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4788  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.02 
 
 
723 aa  60.5  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.468389 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3119  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.49 
 
 
681 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.417733  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.89 
 
 
707 aa  58.9  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  35.27 
 
 
623 aa  58.5  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.91 
 
 
668 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  30.94 
 
 
642 aa  57.4  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3253  protein kinase  32.16 
 
 
660 aa  57.4  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.693838  normal  0.418402 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15820  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 
721 aa  56.6  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0718778 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0962  hypothetical protein  30.39 
 
 
242 aa  56.6  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.915244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  25.21 
 
 
612 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  30.15 
 
 
710 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1396  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.8 
 
 
843 aa  56.2  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  31.58 
 
 
692 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.79 
 
 
613 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0018  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.64 
 
 
693 aa  55.1  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3086  protein kinase  34.62 
 
 
658 aa  54.7  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  30.45 
 
 
485 aa  54.7  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  32.59 
 
 
662 aa  54.7  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.29 
 
 
676 aa  54.7  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.01 
 
 
627 aa  53.9  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  30.54 
 
 
661 aa  53.9  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1569  PASTA domain-containing protein  31.76 
 
 
460 aa  53.9  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.589734  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0744  PASTA domain-containing protein  24.3 
 
 
334 aa  53.9  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.947966  hitchhiker  0.000000811386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  28.74 
 
 
604 aa  53.5  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  29.07 
 
 
668 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
681 aa  53.5  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.79 
 
 
664 aa  52.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  27.72 
 
 
626 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00180  serine/threonine protein kinase  28.11 
 
 
691 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1553  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.64 
 
 
630 aa  52  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1203  PASTA domain containing protein  27.38 
 
 
290 aa  51.6  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26990  protein kinase family protein with PASTA domain  27.14 
 
 
736 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  30.99 
 
 
612 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.61 
 
 
647 aa  51.2  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0923  hypothetical protein  26.67 
 
 
258 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0499839  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1118  PASTA domain-containing protein  27.67 
 
 
204 aa  50.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0063  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.66 
 
 
594 aa  50.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1218  hypothetical protein  30.05 
 
 
244 aa  50.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.574754 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  23.89 
 
 
601 aa  50.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  35.14 
 
 
718 aa  50.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581309  hitchhiker  0.000240605 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  32.39 
 
 
723 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  26.27 
 
 
625 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  20.08 
 
 
666 aa  48.9  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2064  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.24 
 
 
662 aa  48.9  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1846  PASTA domain containing protein  26.39 
 
 
254 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0407237  normal  0.022075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.36 
 
 
681 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.67 
 
 
648 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1196  PASTA  31.72 
 
 
584 aa  48.5  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3036  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.08 
 
 
647 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0172256  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.17 
 
 
603 aa  47.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0986  serine/threonine protein kinase  37.89 
 
 
612 aa  47  0.0008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.640766  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1432  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.17 
 
 
696 aa  47.4  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.610669  normal  0.496135 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  29.46 
 
 
623 aa  47  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3315  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.62 
 
 
661 aa  47  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1104  PASTA domain containing protein  30.05 
 
 
244 aa  46.2  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  31.19 
 
 
758 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13750  serine/threonine protein kinase  31.05 
 
 
636 aa  46.2  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.25 
 
 
662 aa  46.2  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0689  kinase domain protein  26.67 
 
 
796 aa  45.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  34.34 
 
 
602 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1533  PASTA domain containing protein  29.8 
 
 
244 aa  44.3  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0715242  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1975  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.69 
 
 
673 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0030  kinase domain protein  24.35 
 
 
667 aa  43.9  0.008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  22.5 
 
 
653 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4230  PASTA domain-containing protein  34.45 
 
 
252 aa  43.9  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0051  PASTA domain containing protein  32 
 
 
301 aa  43.5  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5256  hypothetical protein  28.77 
 
 
612 aa  43.5  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>