34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0328 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0328  membrane protein-like protein  100 
 
 		 216 aa  419  1e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00221731  hitchhiker  0.00778453 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02140  predicted membrane protein  35.8 
 
 		 205 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1250  hypothetical protein  35.68 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal  0.274152 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0976  hypothetical protein  35.18 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0255663  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0448  hypothetical protein  36.64 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1066  hypothetical protein  27.06 
 
 		 234 aa  62  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0042  hypothetical protein  31.87 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0273863 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2176  hypothetical protein  30.22 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1689  YpdC  28.43 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3157  hypothetical protein  31.05 
 
 		 329 aa  56.2  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0323  hypothetical protein  31.09 
 
 		 442 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168214  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3715  hypothetical protein  32.51 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376902  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05830  predicted membrane protein  28.7 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.42901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3270  membrane protein-like protein  31.61 
 
 		 337 aa  52  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2268  hypothetical protein  30.81 
 
 		 366 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6011  membrane protein-like protein  29.5 
 
 		 406 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111505  normal  0.791396 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0448  hypothetical protein  34.19 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1408  hypothetical protein  30.29 
 
 		 337 aa  47.8  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.34075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3589  hypothetical protein  28.45 
 
 		 313 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1254  hypothetical protein  33.68 
 
 		 347 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35570  predicted membrane protein  32.14 
 
 		 369 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00968721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2583  putative integral membrane protein  32.17 
 
 		 327 aa  46.2  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.003396 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3024  hypothetical protein  31.08 
 
 		 392 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00601193  normal  0.11527 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1985  membrane protein  31.55 
 
 		 470 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.775986  normal  0.0143914 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1405  hypothetical protein  31.36 
 
 		 338 aa  43.5  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.52985  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2972  putative integral membrane protein  28.24 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0552  hypothetical protein  31.37 
 
 		 339 aa  43.5  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1996  putative integral membrane protein  31.43 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2005  putative integral membrane protein  28.57 
 
 		 425 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000213441 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1722  membrane protein-like protein  29.86 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1365  putative integral membrane protein  29.94 
 
 		 377 aa  42.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3033  membrane protein  43.28 
 
 		 388 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3009  hypothetical protein  30.41 
 
 		 392 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3055  hypothetical protein  30.41 
 
 		 392 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>