More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0118 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  100 
 
 		 363 aa  722    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  50.29 
 
 		 352 aa  336  3.9999999999999995e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  48.84 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4228  aminotransferase class I and II  47.92 
 
 		 347 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  47.32 
 
 		 347 aa  298  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4253  aminotransferase class I and II  47.59 
 
 		 347 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00377555  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0323  aminotransferase class I and II  47.84 
 
 		 347 aa  285  8e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.12595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  38.15 
 
 		 371 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0729  histidinol-phosphate aminotransferase  37.13 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.82 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  35.24 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  38.79 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 351 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.27 
 
 		 358 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  35.61 
 
 		 360 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  36.1 
 
 		 374 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  36.57 
 
 		 363 aa  181  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  35.55 
 
 		 375 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  32.56 
 
 		 356 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 357 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  37.75 
 
 		 365 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  32.65 
 
 		 356 aa  179  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  34.45 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  38.86 
 
 		 365 aa  176  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  33.72 
 
 		 363 aa  176  7e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0762  histidinol-phosphate aminotransferase  36.39 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.865966  normal  0.0190089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.14 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  30.59 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 		 355 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  32.07 
 
 		 365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  34.88 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1031  histidinol-phosphate aminotransferase  35.93 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504885 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 365 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  34.31 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0377  histidinol-phosphate aminotransferase  35.65 
 
 		 365 aa  172  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.141472 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 		 356 aa  170  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 		 364 aa  170  4e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 		 357 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  34.02 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  35.19 
 
 		 357 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  35 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2947  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 369 aa  168  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  33.53 
 
 		 357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  32.73 
 
 		 363 aa  166  8e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  34.9 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  31.09 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  35.04 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  32.84 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  30.84 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  36.84 
 
 		 370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  31.08 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5521  histidinol-phosphate aminotransferase  35.01 
 
 		 374 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.284682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_593  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.28275  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4374  histidinol-phosphate aminotransferase  36.01 
 
 		 396 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279737  normal  0.478615 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  35.86 
 
 		 359 aa  159  9e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  31.04 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_002936  DET0655  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.54 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0689  histidinol-phosphate aminotransferase, putative  30.54 
 
 		 368 aa  155  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  32.07 
 
 		 360 aa  153  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  30.07 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0625  L-threonine O-3-phosphate decarboxylase  28.79 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.027617  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  31.5 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.58 
 
 		 364 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  31.6 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01910  Histidinol-phosphate transaminase  32.12 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 		 357 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 358 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2341  class I/II aminotransferase  34.6 
 
 		 382 aa  146  6e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.416124  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  33.23 
 
 		 355 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1477  histidinol-phosphate aminotransferase  26.92 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  28.57 
 
 		 368 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 		 362 aa  143  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  30.17 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1092  histidinol-phosphate aminotransferase  32.02 
 
 		 386 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.72079  normal  0.569129 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1557  class I/II aminotransferase  27.94 
 
 		 356 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  36.36 
 
 		 371 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3241  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471866  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2242  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0938  histidinol-phosphate aminotransferase  34.95 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1710  histidinol-phosphate aminotransferase  29.05 
 
 		 335 aa  140  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  29.18 
 
 		 351 aa  140  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1307  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 		 387 aa  139  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  28.83 
 
 		 349 aa  139  8.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 		 353 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>