More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4973 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4973  chaperone protein DnaJ  100 
 
 		 386 aa  788    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0482542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1521  chaperone protein DnaJ  74.55 
 
 		 388 aa  581  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173202  normal  0.704316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0071  molecular chaperone, heat shock protein  63.8 
 
 		 379 aa  496  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3209  chaperone protein DnaJ  63.38 
 
 		 385 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492328  normal  0.368243 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0979  hypothetical protein  55.73 
 
 		 379 aa  465  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.127432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6905  chaperone protein DnaJ  56.96 
 
 		 389 aa  441  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.725874  normal  0.252864 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1088  chaperone protein DnaJ  48.36 
 
 		 394 aa  377  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.038983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0854  chaperone protein DnaJ  48.87 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000496587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1582  chaperone protein DnaJ  49.49 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.633859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2125  chaperone protein DnaJ  48.19 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.128449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1872  chaperone protein DnaJ  45.94 
 
 		 395 aa  364  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000340868  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1487  chaperone protein DnaJ  49.36 
 
 		 382 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.992778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5050  chaperone protein DnaJ  49.48 
 
 		 368 aa  348  1e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1691  chaperone protein DnaJ  48.75 
 
 		 401 aa  348  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.211452  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1422  chaperone protein DnaJ  44.69 
 
 		 400 aa  341  1e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.234078  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0455  chaperone protein DnaJ  47.67 
 
 		 373 aa  337  1.9999999999999998e-91  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08256  chaperone protein dnaJ  50.26 
 
 		 376 aa  337  1.9999999999999998e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.482747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2238  chaperone protein DnaJ  45.01 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.395624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1797  chaperone protein DnaJ  46.75 
 
 		 379 aa  326  4.0000000000000003e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0730  chaperone protein DnaJ  45.62 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1776  chaperone protein DnaJ  53.8 
 
 		 383 aa  321  9.999999999999999e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3044  chaperone protein DnaJ  45.41 
 
 		 374 aa  315  9e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2495  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 		 373 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0561427  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2828  chaperone protein DnaJ  46.75 
 
 		 376 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000114983  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4726  chaperone protein DnaJ  44.79 
 
 		 375 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.761545  hitchhiker  0.00284815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42960  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 375 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1539  molecular chaperone protein DnaJ  47.93 
 
 		 372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0617832  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1321  chaperone protein DnaJ  43 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62960  chaperone protein DnaJ  45.03 
 
 		 377 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.377489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3623  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 		 375 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2765  chaperone protein DnaJ  45.05 
 
 		 382 aa  305  6e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4194  chaperone protein DnaJ  44.82 
 
 		 380 aa  305  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.993015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4727  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 		 374 aa  305  7e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0106  chaperone protein DnaJ  47.12 
 
 		 373 aa  305  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1751  chaperone protein DnaJ  40.79 
 
 		 376 aa  305  7e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3459  chaperone protein DnaJ  42.01 
 
 		 370 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4592  chaperone protein DnaJ  44.39 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.356534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0764  chaperone protein DnaJ  44.3 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252459  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0706  chaperone protein DnaJ  44.65 
 
 		 374 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.421383  hitchhiker  0.00995799 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0211  chaperone protein DnaJ  43.93 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1398  co-chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 356 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0366797  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2006  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2001  chaperone protein DnaJ  45.08 
 
 		 379 aa  303  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0750  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 373 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.317269  normal  0.478578 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2634  chaperone protein DnaJ  42.17 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00367611  normal  0.591004 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4504  dnaJ protein  45.34 
 
 		 380 aa  301  1e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2834  chaperone protein DnaJ  44.79 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1172  chaperone protein DnaJ  44.79 
 
 		 382 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.696744  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3432  chaperone protein DnaJ  42.68 
 
 		 388 aa  300  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0520699  normal  0.082957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5480  chaperone protein DnaJ  45.03 
 
 		 377 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0586  chaperone DnaJ  45.95 
 
 		 382 aa  300  3e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1184  chaperone protein DnaJ  45.03 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0143708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2784  chaperone protein DnaJ  44.33 
 
 		 379 aa  299  4e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1207  chaperone protein DnaJ  44.78 
 
 		 359 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2056  chaperone protein DnaJ  42.3 
 
 		 374 aa  299  6e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3531  chaperone protein DnaJ  45.45 
 
 		 372 aa  299  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12790  chaperone protein DnaJ  42.82 
 
 		 375 aa  298  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000108352  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1180  molecular chaperone, DnaJ family  44.23 
 
 		 356 aa  297  2e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.642107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2499  chaperone protein DnaJ  43.43 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.47726  normal  0.719527 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3093  chaperone DnaJ  43.44 
 
 		 381 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0535684  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2869  chaperone protein DnaJ  43.73 
 
 		 382 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1460  chaperone protein DnaJ  45.63 
 
 		 385 aa  296  4e-79  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0922  heat shock protein DnaJ  45.57 
 
 		 378 aa  295  7e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.193954  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2436  chaperone protein DnaJ  42.5 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00797991  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3573  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1514  chaperone DnaJ  41.19 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1711  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 378 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.926786  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4393  chaperone protein DnaJ  41.49 
 
 		 370 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3504  chaperone protein DnaJ  43.86 
 
 		 374 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000140999  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1311  chaperone protein DnaJ  43.25 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3242  chaperone DnaJ  43.08 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.109934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3582  chaperone protein DnaJ  43.19 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000132577  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2463  chaperone protein DnaJ  43.22 
 
 		 382 aa  293  4e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.820869  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0269  chaperone protein DnaJ  41.46 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0753  chaperone protein DnaJ  41.46 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0722  chaperone protein DnaJ  41.46 
 
 		 378 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1995  chaperone protein DnaJ  41.56 
 
 		 379 aa  293  5e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.396046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3079  chaperone protein DnaJ  42.6 
 
 		 376 aa  293  5e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000309129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0647  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0670  chaperone protein DnaJ  41.71 
 
 		 378 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1014  chaperone protein DnaJ  44.02 
 
 		 382 aa  293  5e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02252  chaperone protein DnaJ  44.27 
 
 		 389 aa  292  6e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.139238  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0623  chaperone protein DnaJ  42.67 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.187499  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0018  chaperone protein DnaJ  42.71 
 
 		 388 aa  291  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.253679  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2496  chaperone protein DnaJ  41.94 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.840504 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2632  chaperone protein DnaJ  41.67 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3658  chaperone protein DnaJ  42.34 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.415676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1127  chaperone protein DnaJ  42.89 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2325  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2204  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4327  chaperone DnaJ  42.19 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0104761  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0978  chaperone protein DnaJ  44.25 
 
 		 381 aa  290  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.352568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1097  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0502  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 		 376 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2921  chaperone protein DnaJ  43.94 
 
 		 379 aa  290  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0121301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3852  chaperone protein DnaJ  42.34 
 
 		 378 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1377  chaperone protein DnaJ  41.6 
 
 		 375 aa  291  2e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3408  chaperone protein DnaJ  42.42 
 
 		 378 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.4894  hitchhiker  0.00217472 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3276  chaperone protein DnaJ  42.78 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3410  chaperone protein DnaJ  43.26 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129468  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>