235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4882 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4882  nitrogen-fixing NifU domain protein  100 
 
 		 198 aa  406  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.436115  normal  0.113106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2479  nitrogen-fixing NifU domain protein  70.05 
 
 		 200 aa  277  7e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40084  normal  0.245689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  55.78 
 
 		 191 aa  204  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0722  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 198 aa  191  7e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0513742 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2934  nitrogen-fixing NifU domain protein  49.74 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0974289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1676  NifU domain-containing protein  41.15 
 
 		 299 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  42.02 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  41.49 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1955  nitrogen-fixing NifU domain protein  42.7 
 
 		 299 aa  143  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  41.8 
 
 		 187 aa  141  7e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30771  predicted protein  40.62 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.777457  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3028  NifU domain-containing protein  39.47 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01075  NifU-like domain protein  39.81 
 
 		 305 aa  137  7.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  39.89 
 
 		 186 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  39.68 
 
 		 187 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0865  nitrogen-fixing NifU-like  39.68 
 
 		 187 aa  135  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  36.56 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  39.89 
 
 		 186 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0019  scaffold protein Nfu/NifU  38.95 
 
 		 189 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.01661  normal  0.743316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  38.95 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3394  Scaffold protein Nfu/NifU  38.14 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  38.97 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3522  Scaffold protein Nfu/NifU  37.63 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.128195  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3198  scaffold protein Nfu/NifU  37.63 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.113842  normal  0.941743 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  38.14 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0202  NifU domain-containing protein  35.94 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.419863  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4429  Scaffold protein Nfu/NifU  38.22 
 
 		 187 aa  121  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.021918  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16693  predicted protein  38.38 
 
 		 195 aa  121  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  37.76 
 
 		 192 aa  121  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  37.77 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  37.95 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0040  putative nifU protein  37.63 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.15873  normal  0.567558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  39.38 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  38.02 
 
 		 186 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  37.31 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  38.42 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  38.14 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  38.95 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  37.63 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  36.22 
 
 		 190 aa  118  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3394  scaffold protein Nfu/NifU  37.82 
 
 		 187 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.252706 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  32.67 
 
 		 326 aa  118  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76567  predicted protein  34.04 
 
 		 242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.000975228 
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  37.11 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  37.11 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2380  scaffold protein Nfu/NifU-like protein  36.22 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  35.94 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  37.82 
 
 		 186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  36.07 
 
 		 188 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0988  nitrogen-fixing NifU-like  36 
 
 		 195 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0009  nitrogen-fixing NifU  35.68 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964123  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0644  scaffold protein Nfu/NifU  39.18 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.728561 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01900  iron ion homeostasis-related protein, putative  36.79 
 
 		 309 aa  104  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  31.77 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  36.41 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  35.83 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  35.87 
 
 		 188 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0817  NifU-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.946784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1865  nitrogen-fixing NifU-like  30.26 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0701  nitrogen-fixing NifU-like  30.73 
 
 		 186 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1051  scaffold protein Nfu/NifU  36.41 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.906453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  50 
 
 		 72 aa  72.4  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  52.78 
 
 		 87 aa  71.6  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03110  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.97 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0962  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.42 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1070  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.89 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.14 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  50.68 
 
 		 74 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  49.32 
 
 		 74 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.07 
 
 		 74 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 73 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2284  NifU domain-containing protein  50.7 
 
 		 74 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000278833  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1632  NifU-like protein  54.79 
 
 		 72 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000186996  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  38.38 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0260  NifU domain-containing protein  46.67 
 
 		 74 aa  66.6  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2861  nitrogen-fixing NifU-like protein  44 
 
 		 80 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1514  NifU domain protein  56.16 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000120627  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  45.21 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  46.88 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  46.67 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  46.67 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  46.58 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  47.95 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  46.67 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1377  NifU domain-containing protein  54.79 
 
 		 72 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000465416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  46.58 
 
 		 73 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3034  nitrogen-fixing NifU-like  43.06 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  48.65 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  49.18 
 
 		 74 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1148  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.52272 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  43.84 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1119  nitrogen-fixing NifU domain protein  43.06 
 
 		 79 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  47.14 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1107  nitrogen-fixing NifU domain protein  44.78 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162394  hitchhiker  0.0000000000000133842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2023  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.67 
 
 		 81 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.22 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  43.84 
 
 		 81 aa  61.6  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3441  nitrogen-fixing NifU domain-containing protein  38.89 
 
 		 79 aa  61.6  0.000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>