More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4132 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4132  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  100 
 
 		 610 aa  1263    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5542  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  44.37 
 
 		 610 aa  489  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3595  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.84 
 
 		 607 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0161652  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0988  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  37.22 
 
 		 615 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04875  DNA mismatch repair protein mutS  31.77 
 
 		 601 aa  323  7e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2141  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.71 
 
 		 624 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2469  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.11 
 
 		 626 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1114  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.57 
 
 		 605 aa  300  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2411  MutS domain-containing protein  31.55 
 
 		 595 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.133991  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2123  MutS domain-containing protein  31.55 
 
 		 595 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2709  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  32.37 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0186895  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0156  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.91 
 
 		 586 aa  281  3e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2027  MutS-like mismatch repair protein, ATPase  30.12 
 
 		 596 aa  280  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1070  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  33.05 
 
 		 593 aa  279  9e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0359  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.8 
 
 		 598 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2236  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 		 590 aa  276  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0247  DNA mismatch repair protein MutS-like protein  31.5 
 
 		 601 aa  263  8e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2547  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  36.17 
 
 		 597 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2451  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  35.76 
 
 		 597 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.412357  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0656  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.28 
 
 		 604 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1406  DNA mismatch repair protein MutS-like  36.36 
 
 		 597 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3182  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.28 
 
 		 618 aa  217  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2424  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  36.51 
 
 		 594 aa  203  8e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.720949  normal  0.166887 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0562  DNA mismatch repair protein MutS-like  40.56 
 
 		 243 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2122  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.21 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0365547  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2085  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  33.21 
 
 		 536 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00891152  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1160  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  35.94 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2383  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  30.49 
 
 		 558 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.356876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0552  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.88 
 
 		 555 aa  121  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0706  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  34.76 
 
 		 438 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0886  MutS domain-containing protein  29.71 
 
 		 557 aa  120  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437767  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1660  MutS family protein  31.74 
 
 		 538 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0300  MutS domain-containing protein  30.64 
 
 		 521 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0622  DNA mismatch repair protein MutS domain-containing protein  45.61 
 
 		 112 aa  106  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000499338  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0305  MutS domain-containing protein  30.21 
 
 		 521 aa  104  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.667577  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  33.65 
 
 		 860 aa  101  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1166  MutS2 family protein  34.69 
 
 		 761 aa  99.4  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.690197  normal  0.0205926 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1769  DNA mismatch repair protein MutS  32.34 
 
 		 846 aa  97.4  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1768  DNA mismatch repair protein MutS  31.84 
 
 		 846 aa  97.1  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7097  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  26.47 
 
 		 443 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000373438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2226  DNA mismatch repair protein MutS  30.77 
 
 		 956 aa  92.8  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.137389  normal  0.561287 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1104  MutS2 family protein  33.16 
 
 		 750 aa  91.7  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  28.76 
 
 		 895 aa  90.1  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  29.49 
 
 		 853 aa  89.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 890 aa  90.1  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 890 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 890 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  31.41 
 
 		 892 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  89  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3053  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  28.74 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 894 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  29.18 
 
 		 892 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1486  DNA mismatch repair protein MutS  28.29 
 
 		 867 aa  88.6  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.387316  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  31.43 
 
 		 864 aa  88.2  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2101  DNA mismatch repair protein MutS  25.64 
 
 		 858 aa  88.2  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2380  DNA mismatch repair protein MutS  28.5 
 
 		 893 aa  87.8  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  29.02 
 
 		 903 aa  87.4  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3819  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.38 
 
 		 445 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.081272  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  29.22 
 
 		 882 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0824  recombination and DNA strand exchange inhibitor protein  30.81 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  31.88 
 
 		 903 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  30.2 
 
 		 882 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  27.63 
 
 		 872 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  32.11 
 
 		 858 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  35.44 
 
 		 874 aa  84.3  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 905 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  30.36 
 
 		 868 aa  84.7  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 857 aa  84.7  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02590  mismatch repair-related protein, putative  29.86 
 
 		 1205 aa  84.3  0.000000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.102659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  30.24 
 
 		 872 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3531  DNA mismatch repair protein MutS  30.14 
 
 		 1088 aa  84  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  30.09 
 
 		 898 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2284  DNA mismatch repair protein MutS  30.32 
 
 		 897 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.339354  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3706  DNA mismatch repair protein MutS  29.67 
 
 		 1085 aa  83.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0191943 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1115  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 		 793 aa  83.2  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  26.56 
 
 		 887 aa  83.2  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0330  DNA mismatch repair protein MutS  28.34 
 
 		 917 aa  83.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1809  MutS family DNA structure-specific ATPase  28.24 
 
 		 776 aa  83.2  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.284001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  30.88 
 
 		 855 aa  82.8  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2666  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  31.18 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.892577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  28.86 
 
 		 900 aa  82.8  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2667  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  25.2 
 
 		 442 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  27.35 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1015  DNA mismatch repair protein MutS  29.76 
 
 		 793 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  27.98 
 
 		 930 aa  82.4  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1737  MutS family DNA structure-specific ATPase  27.19 
 
 		 783 aa  82.8  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1520  DNA mismatch repair protein MutS  32.11 
 
 		 848 aa  82  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0458  DNA mismatch repair protein MutS  31.22 
 
 		 865 aa  82  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.143165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3337  DNA mismatch repair protein MutS  27.66 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0366  DNA mismatch repair protein MutS  29.08 
 
 		 914 aa  82  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0942134  normal  0.39879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  27.23 
 
 		 854 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3054  DNA mismatch repair protein MutS domain protein  27.53 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.613085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  27.75 
 
 		 904 aa  80.9  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1437  DNA mismatch repair protein MutS  26.82 
 
 		 870 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.787998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1760  DNA mismatch repair protein MutS  26.82 
 
 		 870 aa  80.9  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  30.85 
 
 		 968 aa  80.9  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>