More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3818 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3818  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 430 aa  885    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0225862  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5630  seryl-tRNA synthetase  72.33 
 
 		 423 aa  613  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00319039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0847  seryl-tRNA synthetase  64.88 
 
 		 423 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3604  seryl-tRNA synthetase  64.65 
 
 		 423 aa  566  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0415  seryl-tRNA synthetase  63.95 
 
 		 423 aa  551  1e-156  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.406558 
 
 
-
 
NC_002950  PG0316  seryl-tRNA synthetase  63.02 
 
 		 423 aa  545  1e-154  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.317147 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03775  seryl-tRNA synthetase  62.7 
 
 		 423 aa  541  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.64354  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0734  seryl-tRNA synthetase  61.07 
 
 		 423 aa  530  1e-149  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0216  seryl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 424 aa  525  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1519  hypothetical protein  54.78 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.833428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1968  seryl-tRNA synthetase  51.04 
 
 		 426 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.355575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2731  seryl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104172 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2115  seryl-tRNA synthetase  47.11 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0145556 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  43.68 
 
 		 431 aa  362  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  44.7 
 
 		 427 aa  361  1e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 422 aa  356  5e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  44.73 
 
 		 427 aa  354  1e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 422 aa  352  8e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 420 aa  352  1e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  43.82 
 
 		 422 aa  349  4e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 430 aa  349  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0825  seryl-tRNA synthetase  43.55 
 
 		 427 aa  349  7e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.771006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 432 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  344  2e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1823  seryl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 424 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  342  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 424 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1129  seryl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 432 aa  342  8e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  342  9e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 425 aa  341  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3252  seryl-tRNA synthetase  45.03 
 
 		 433 aa  342  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00693553  hitchhiker  0.00000188332 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  43.78 
 
 		 426 aa  340  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  42.02 
 
 		 423 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 428 aa  339  5.9999999999999996e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0953  seryl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.37183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 427 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1765  seryl-tRNA synthetase  40.69 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3767  seryl-tRNA synthetase  45.09 
 
 		 439 aa  336  5e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 425 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  44.11 
 
 		 427 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 426 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 424 aa  334  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0695  seryl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 426 aa  334  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0194542  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 421 aa  335  1e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0931  seryl-tRNA synthetase  42.53 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  45.34 
 
 		 430 aa  334  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_516  seryl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 413 aa  333  5e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 423 aa  332  7.000000000000001e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3243  seryl-tRNA synthetase  44.24 
 
 		 452 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.581766  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0744  seryl-tRNA synthetase  40.67 
 
 		 461 aa  332  9e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124446  normal  0.521424 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 429 aa  332  9e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  42.39 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1908  seryl-tRNA synthetase  43.94 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.301857  hitchhiker  0.00000878717 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 423 aa  330  3e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  44.22 
 
 		 424 aa  330  3e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 423 aa  330  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  41.45 
 
 		 423 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  43.95 
 
 		 427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 430 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3466  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0550  seryl-tRNA synthetase  40.37 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 428 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 422 aa  327  3e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4028  seryl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 443 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792867  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0628  seryl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 435 aa  326  5e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0256221  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3445  seryl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 442 aa  326  6e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3335  seryl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 444 aa  326  6e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0577  seryl-tRNA synthetase  40.84 
 
 		 413 aa  325  7e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2772  seryl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 442 aa  325  7e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.521327  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  42.95 
 
 		 438 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  43.62 
 
 		 425 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 423 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 423 aa  324  2e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003876  seryl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00729663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 421 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3651  seryl-tRNA synthetase  43.05 
 
 		 438 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0461818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0850  seryl-tRNA synthetase  44.03 
 
 		 426 aa  323  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.154901  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  43.79 
 
 		 427 aa  323  5e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0794  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.67 
 
 		 427 aa  322  6e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1494  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 424 aa  322  6e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.457179 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2118  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.510487  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3072  seryl-tRNA synthetase  43.97 
 
 		 433 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0946131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>