More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3738 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3738  ribosomal protein L11 methyltransferase  100 
 
 
312 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5617  ribosomal L11 methyltransferase  60.51 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1993  ribosomal protein L11 methyltransferase  45.68 
 
 
278 aa  232  6e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3276  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.73 
 
 
279 aa  209  5e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3507  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.93 
 
 
293 aa  207  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1569  ribosomal protein L11 methyltransferase  39.29 
 
 
278 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.641228  normal  0.177131 
 
 
-
 
NC_002950  PG0635  ribosomal protein L11 methyltransferase  42.8 
 
 
311 aa  196  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.312814 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6514  ribosomal protein L11 methyltransferase  40.43 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.210209  normal  0.104822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13478  putative ribosomal protein L11 methyltransferase  42.09 
 
 
276 aa  179  7e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.248729  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2327  ribosomal L11 methyltransferase  33.45 
 
 
285 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2421  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.15 
 
 
293 aa  142  8e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2021  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.4 
 
 
288 aa  139  6e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2820  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
288 aa  137  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2061  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.81 
 
 
286 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2179  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.45 
 
 
290 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1994  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
316 aa  132  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.467353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2447  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.99 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1500  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.97 
 
 
299 aa  127  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2585  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.97 
 
 
289 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.188755  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2494  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.28 
 
 
308 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00440175  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2871  ribosomal L11 methyltransferase  33.65 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2284  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
313 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1796  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.11 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1999  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.6 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2156  ribosomal L11 methyltransferase  31.38 
 
 
296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.176074 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2959  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000148567  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1432  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.12 
 
 
283 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.362511  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.17 
 
 
318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3447  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.36 
 
 
300 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.801921  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0972  ribosomal protein L11 methyltransferase  25 
 
 
315 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1188  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.16 
 
 
296 aa  110  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.158292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1320  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.96 
 
 
313 aa  109  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.740107  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0855  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.17 
 
 
315 aa  109  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000257486  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1146  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.06 
 
 
312 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3386  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.44 
 
 
299 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0387461  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3937  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.78 
 
 
296 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0015501  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2286  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  32.84 
 
 
299 aa  107  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0442  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.87 
 
 
294 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1549  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.53 
 
 
304 aa  105  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2687  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.33 
 
 
295 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000011349  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2623  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.03 
 
 
298 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.906319 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2837  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.19 
 
 
294 aa  104  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.104112  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0267  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
287 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0167166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0246  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  31.73 
 
 
287 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0486812  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3033  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.35 
 
 
298 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2691  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.78 
 
 
303 aa  104  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000606205  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0256  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.39 
 
 
287 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00173  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.52 
 
 
295 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12780  ribosomal protein L11 methyltransferase  29.25 
 
 
289 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000157571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2309  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.12 
 
 
333 aa  103  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000281824  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3109  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.08 
 
 
321 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00713701  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2376  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.46 
 
 
296 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0572  ribosomal protein L11 methyltransferase  38.25 
 
 
300 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000573675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1015  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.04 
 
 
312 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0810  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.51 
 
 
292 aa  102  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0243  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.29 
 
 
295 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1004  ribosomal L11 methyltransferase  34.11 
 
 
282 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2427  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.08 
 
 
296 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.493009  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0241  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.88 
 
 
306 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000356795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3686  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.57 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0120  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0505  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0603  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3155  ribosomal L11 methyltransferase  30.59 
 
 
286 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.11124 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2781  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0529  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.7 
 
 
300 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.579214  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15391  ribosomal protein L11 methyltransferase  25 
 
 
303 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3376  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.17 
 
 
295 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0208  ribosomal protein L11 methyltransferase  34.38 
 
 
506 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00971698  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3428  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.3 
 
 
300 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.244966  normal  0.0610073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0239  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.14 
 
 
295 aa  99.8  5e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0718  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.64 
 
 
319 aa  99.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000247625  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2788  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.27 
 
 
298 aa  99.8  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002195  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.42 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00271176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0367  ribosomal protein L11 methyltransferase  28.57 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0506  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.82 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0662184  hitchhiker  0.00329443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2631  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.63 
 
 
300 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0925  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.47 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1576  ribosomal protein L11 methyltransferase-like protein  32.58 
 
 
307 aa  98.2  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0767269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3897  ribosomal protein L11 methyltransferase  27.68 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147825 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1210  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000191055  normal  0.886421 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0388  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000022526  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3845  ribosomal protein L11 methyltransferase  31.22 
 
 
295 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.393013  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1636  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0215506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0454  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.61 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.281322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1670  ribosomal protein L11 methyltransferase  30 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1451  ribosomal protein L11 methyltransferase  24.5 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.279923  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0530  ribosomal protein L11 methyltransferase  37.3 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.982055  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3791  ribosomal protein L11 methyltransferase  25.94 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.220237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  30.58 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2503  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3281  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3502  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3467  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1161  ribosomal protein L11 methyltransferase  36.07 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.879401  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1283  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0401  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.42 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0130632  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3624  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.42 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000162524  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0424  ribosomal protein L11 methyltransferase  35.71 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0400  ribosomal protein L11 methyltransferase  32.42 
 
 
293 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0151894  normal  0.0533338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>