26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1685 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1459  Heparinase II/III family protein  53.27 
 
 		 626 aa  658    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.230111  normal  0.696506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1685  hypothetical protein  100 
 
 		 629 aa  1306    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.238249  normal  0.0538261 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2455  Heparinase II/III family protein  51.04 
 
 		 628 aa  668    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2654  hypothetical protein  42.11 
 
 		 847 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.246589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2650  hypothetical protein  32.62 
 
 		 1194 aa  333  8e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3947  thr operon leader peptide  30.14 
 
 		 624 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3391  Heparinase II/III family protein  32.16 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0366049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3390  coagulation factor 5/8 type domain protein  33.03 
 
 		 1246 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.032281  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03380  expressed protein  28.07 
 
 		 843 aa  153  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108531  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3868  Heparinase II/III family protein  27.02 
 
 		 628 aa  82.8  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103442  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0131  hypothetical protein  23.96 
 
 		 566 aa  68.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3961  hypothetical protein  22.93 
 
 		 647 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2603  hypothetical protein  22.59 
 
 		 637 aa  59.3  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1390  Heparinase II/III family protein  25.95 
 
 		 1200 aa  56.2  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.274329  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2894  heparinase II/III family protein  22.03 
 
 		 694 aa  55.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5337  Heparinase II/III family protein  22.66 
 
 		 597 aa  55.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2009  hypothetical protein  25.16 
 
 		 581 aa  54.3  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.077757 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5054  Heparinase II/III family protein  22.48 
 
 		 598 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.124625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0961  hypothetical protein  21.61 
 
 		 645 aa  48.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.600462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21320  hypothetical protein  22.44 
 
 		 660 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.12083  normal  0.0898044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4959  hypothetical protein  21.63 
 
 		 644 aa  47.4  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3564  heparinase II/III family protein  25.33 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2833  hypothetical protein  24.36 
 
 		 893 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00592352  normal  0.0101157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0606  Heparinase II/III family protein  21.84 
 
 		 705 aa  45.4  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1169  Heparinase II/III family protein  24.5 
 
 		 870 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0488  heparinase II/III family protein  20.2 
 
 		 761 aa  44.3  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>