237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0861 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
291 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  36.96 
 
 
301 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.02 
 
 
289 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.88 
 
 
293 aa  170  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.97 
 
 
290 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  31.72 
 
 
296 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.12 
 
 
291 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  31.02 
 
 
294 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.45 
 
 
285 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0299  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.39 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  31.16 
 
 
291 aa  136  4e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.17 
 
 
305 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  31.98 
 
 
305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.81 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.23 
 
 
289 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.48 
 
 
300 aa  125  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.05 
 
 
303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.27 
 
 
289 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.36 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.62 
 
 
301 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.02 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.71 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.86 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.5 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3013  hypothetical protein  26.77 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.46 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1400  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.02 
 
 
294 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.15807  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.74 
 
 
331 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.83 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2871  hypothetical protein  26.14 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  23.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0091  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.1 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  3.20125e-16  hitchhiker  0.00000076375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3230  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.92 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  21.64 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  23.81 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2870  hypothetical protein  21.43 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.83 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  24.73 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0846  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.83 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  23.81 
 
 
281 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.04 
 
 
313 aa  68.9  0.00000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
286 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3026  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.45 
 
 
316 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.7 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.41 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.68 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.22 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.51 
 
 
302 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2592  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.29 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00440873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.56 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.72 
 
 
453 aa  66.6  0.0000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3414  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.44 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.99 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.55 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0471  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.6 
 
 
297 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0100741  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.2 
 
 
308 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
295 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3420  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase, putative  23.49 
 
 
307 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.84 
 
 
334 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1151  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.94 
 
 
295 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.372563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0587  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.58 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.84 
 
 
340 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  22.13 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0183  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.3 
 
 
305 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.37 
 
 
319 aa  63.2  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4217  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.39 
 
 
284 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.557701  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.58 
 
 
295 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.180229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1786  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.86 
 
 
337 aa  62.4  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.175818  normal  0.0660981 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2638  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  22.92 
 
 
307 aa  62.4  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.202848  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  19.11 
 
 
291 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1520  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.26 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1062  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.87 
 
 
289 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.478716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2620  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.1 
 
 
308 aa  61.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.4407 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.55 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2522  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  27.98 
 
 
287 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.365581 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1127  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.28 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0135  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  29.41 
 
 
305 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.455376  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.41 
 
 
312 aa  60.1  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0014  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.22 
 
 
295 aa  59.7  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00841404  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001825  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.59 
 
 
316 aa  59.7  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000174296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0038  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.18 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0032  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.18 
 
 
297 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  23.05 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1962  acyltransferase, putative  23.08 
 
 
304 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.313582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00650  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.48 
 
 
316 aa  58.9  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0851  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.93 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.6 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0843  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.93 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3201  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  22.52 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.16 
 
 
281 aa  58.2  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1229  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.23 
 
 
297 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2561  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  20.74 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995658  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.08 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0365  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.59 
 
 
291 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0338088 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0809  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.53 
 
 
294 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83439  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2004  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.62 
 
 
315 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.12 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04067  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.91 
 
 
295 aa  56.2  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413363  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0661  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.11 
 
 
282 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0888578  hitchhiker  0.00380684 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.91 
 
 
284 aa  56.2  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>