More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0362 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0362  CinA domain protein  100 
 
 		 164 aa  331  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  0.424027 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1723  CinA domain protein  56.38 
 
 		 170 aa  167  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0236925  hitchhiker  0.000170556 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4162  CinA domain-containing protein  47.77 
 
 		 157 aa  158  4e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.413658  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2475  CinA-like  43.95 
 
 		 162 aa  134  8e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3119  competence/damage-inducible protein CinA  37.41 
 
 		 415 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0227  competence/damage-inducible protein CinA  37.4 
 
 		 408 aa  84.3  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0225  competence/damage-inducible protein CinA  37.3 
 
 		 408 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1458  CinA domain protein  36.64 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000315505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3162  CinA domain protein  32.65 
 
 		 160 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0783  competence/damage-inducible protein CinA  38.61 
 
 		 401 aa  79.3  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0626  competence damage-inducible protein A  28.97 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0064  CinA domain protein  39.5 
 
 		 434 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3551  competence damage-inducible protein A  37.72 
 
 		 412 aa  77.4  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000521176  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1187  competence damage-inducible protein A  37.5 
 
 		 416 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000174522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0842  competence damage-inducible protein A  31.85 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.89652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2403  competence/damage-inducible protein CinA  31.88 
 
 		 412 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3194  CinA domain-containing protein  34.15 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000125042  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02901  molybdenum cofactor biosynthesis protein  32.14 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1725  competence/damage inducible protein CinA  33.78 
 
 		 160 aa  74.7  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2329  competence/damage-inducible protein CinA  32.54 
 
 		 408 aa  74.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000230226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3105  competence damage-inducible protein A  31.76 
 
 		 420 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000208181  normal  0.532071 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1623  competence/damage-inducible protein cinA  32.82 
 
 		 430 aa  73.9  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2558  competence/damage-inducible protein cinA  35.61 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109566  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1622  CinA-like  35.71 
 
 		 165 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.371737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2850  CinA, C-terminal  32.17 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02831  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.08 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0364  CinA domain protein  32.59 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0301  hypothetical protein  35.45 
 
 		 416 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.241188 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1628  competence damage-inducible protein A  31.76 
 
 		 413 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00321197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3815  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000142922  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0833  CinA domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10710  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  29.87 
 
 		 371 aa  72  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00012453  unclonable  0.00000000162574 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0125  competence/damage-inducible protein CinA  32.19 
 
 		 400 aa  72  0.000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0114565  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03351  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.33 
 
 		 430 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.120334  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3540  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000669667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2080  competence damage-inducible protein A  32.39 
 
 		 414 aa  71.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1420  competence damage-inducible protein A  34.75 
 
 		 412 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000863495  normal  0.3879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0064  competence/damage-inducible protein CinA  31.3 
 
 		 411 aa  71.6  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000939052  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0430  competence/damage-inducible protein CinA  35.4 
 
 		 414 aa  71.6  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1389  competence/damage-inducible protein CinA  33.87 
 
 		 403 aa  71.6  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3828  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  71.6  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000100501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1357  competence/damage-inducible protein CinA  34.17 
 
 		 417 aa  71.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3630  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000773442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3916  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  71.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000292498  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1456  competence/damage-inducible protein cinA  33.08 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.129806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3522  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000279724  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0980  competence damage-inducible protein A  29.8 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3793  competence damage-inducible protein A  35.71 
 
 		 412 aa  70.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000239407 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2330  competence/damage-inducible protein CinA  40.19 
 
 		 418 aa  70.9  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.261185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3745  competence/damage-inducible protein CinA  35.46 
 
 		 410 aa  70.5  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.952962 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2089  competence-damaged protein  35.96 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1458  CinA-like  30.77 
 
 		 161 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0695046  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3049  CinA-like protein  31.41 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11920  competence/damage-inducible protein CinA  34.78 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000353424  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2432  competence damage-inducible protein A  34.82 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.238579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0995  competence damage-inducible protein A  32.88 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.108193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1870  CinA-like  31.06 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0903  CinA domain protein  30.77 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00227133 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07190  competence/damage-inducible protein cinA  36.94 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.372167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1620  CDP-diacylglycerol/glycerol-3-phosphate3- phospha tidyltransferase  30.94 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00104405  hitchhiker  0.0000000065258 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1586  competence/damage-inducible protein CinA  36.61 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105098  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1471  competence/damage-inducible protein CinA  32.65 
 
 		 432 aa  68.9  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000360064  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3879  competence damage-inducible protein A  34.82 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000712597  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3628  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 414 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1922  competence damage-inducible protein A  37.39 
 
 		 411 aa  68.6  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0155904  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0128  competence damage-inducible protein A  28.95 
 
 		 412 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0212  competence/damage inducible protein CinA  34.96 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.429483 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0255  competence/damage-inducible protein cinA  36.28 
 
 		 419 aa  67.8  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0217  competence/damage-inducible protein CinA  32.86 
 
 		 420 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02801  molybdenum cofactor biosynthesis protein  27.21 
 
 		 424 aa  67.8  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.441283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0143  competence/damage-inducible protein CinA  30.94 
 
 		 413 aa  67.4  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0781  CinA domain protein  33.82 
 
 		 165 aa  67.4  0.00000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000616829  normal  0.0277412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0797  competence/damage-inducible protein cinA  30.38 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3304  competence/damage-inducible protein CinA  37.61 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.102145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1871  competence/damage-inducible protein CinA  28.97 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0858152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0130  competence damage-inducible protein A  28.95 
 
 		 412 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135469  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0674  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 415 aa  67  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0848574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0354  CinA domain-containing protein  32.82 
 
 		 179 aa  67  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1291  competence/damage inducible protein CinA  32.12 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0461507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0196  competence/damage-inducible protein cinA  31.16 
 
 		 413 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47995  normal  0.513575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0015  CinA-like  30.2 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3471  competence/damage-inducible protein CinA  32.81 
 
 		 417 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3016  CinA domain-containing protein  26.88 
 
 		 166 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633216  hitchhiker  0.000000000145641 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2702  competence/damage-inducible protein CinA  36.61 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0653  CinA domain protein  30.99 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0311323  normal  0.46812 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23250  competence/damage-inducible protein cinA  28.3 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.668566  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0482  CinA domain protein  32.77 
 
 		 369 aa  65.5  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0985  competence/damage-inducible protein CinA  32 
 
 		 411 aa  65.5  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000422375  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3683  competence/damage-inducible protein CinA  33.08 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07490  CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase  30.6 
 
 		 436 aa  65.1  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.042487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0781  CinA-like  29.17 
 
 		 362 aa  65.1  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00322218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1102  competence/damage-inducible protein cinA  32.58 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3733  competence/damage-inducible protein CinA  32.84 
 
 		 414 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0492  competence/damage-inducible protein cinA  36.3 
 
 		 382 aa  64.7  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1052  competence/damage-inducible protein CinA  33.33 
 
 		 413 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000170345  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1776  CinA domain protein  35 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3752  competence/damage-inducible protein CinA  31.03 
 
 		 408 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13568  putative competence-damage inducible  23.33 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1121  competence/damage-inducible protein CinA  34.45 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.030015  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7846  CinA domain protein  28.87 
 
 		 170 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.254441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>