80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1844 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1844  transport-associated  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2802  transport-associated  46.91 
 
 		 184 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2204  transport-associated  41.83 
 
 		 176 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2000  transport-associated protein  31.67 
 
 		 185 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0471437  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0273  transport-associated  31.16 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0122562 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0386  transport-associated  27.87 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3695  transport-associated  27.47 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.904296  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3462  transport-associated  28.31 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0218  transport-associated  32.74 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.011843 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0349  transport-associated protein  26.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.118689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0204  transport-associated  32.74 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0297  putative lipoprotein  27.37 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3393  periplasmic or secreted lipoprotein  32.32 
 
 		 265 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3898  putative phospholipid-binding protein  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0039  phospholipid-binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3817  putative phospholipid-binding protein  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.262069  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0022  putative phospholipid-binding protein  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0386174  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2799  transporter, putative  31.71 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00116321  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1193  transport-associated protein  25.37 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3146  transporter, putative  31.25 
 
 		 266 aa  53.5  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4102  transport-associated  26.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0292  transport-associated  31.1 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4190  transport-associated  26.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0199  transport-associated protein  30.52 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.89233  unclonable  0.00000000000748386 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2814  transport-associated  31.1 
 
 		 266 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3992  transport-associated  26.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4072  transport-associated  26.4 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3687  transport-associated  26.84 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0258  transport-associated  26.84 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0366  transport-associated, putative  24.61 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3883  transport-associated  26.84 
 
 		 188 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.180812 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1744  putative phospholipid-binding protein  29.73 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3178  putative phospholipid-binding protein  29.73 
 
 		 256 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2319  phospholipid-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 104 aa  52  0.000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2048  transport-associated  40.62 
 
 		 104 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1939  phospholipid-binding domain-containing protein  40.62 
 
 		 104 aa  52  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315443  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0249  transport-associated  26.11 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0224  transport-associated  26.79 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.130883  normal  0.197651 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0589  phospholipid-binding domain-containing protein  21.55 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1195  transport-associated protein  28.86 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3428  transport-associated  29.88 
 
 		 284 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3357  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0264  transport-associated  33.87 
 
 		 187 aa  49.3  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.47721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1716  periplasmic phospholipid binding protein  37.5 
 
 		 121 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.547226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2199  putative transport-associated  22.5 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3696  transport-associated  26.52 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.148519  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4254  transport-associated  26.95 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62690  hypothetical protein  38.98 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5747  hypothetical protein  37.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.401679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5456  hypothetical protein  38.98 
 
 		 114 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6500  hypothetical protein  39.19 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.193571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5191  transport-associated  32.03 
 
 		 123 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3177  transport-associated  32.03 
 
 		 123 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944582  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5086  transport-associated  32.03 
 
 		 123 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3026  transport-associated protein  40.91 
 
 		 124 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.311021  normal  0.461623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3587  transport-associated  27.23 
 
 		 191 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43670  Transport-associated protein  28.72 
 
 		 120 aa  45.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.226738  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3575  transport-associated protein  25.79 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.913691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0270  transport-associated  25.45 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000691335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2719  putative phospholipid-binding protein  40.24 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2979  transport-associated protein  40.91 
 
 		 140 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.484552  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3063  hypothetical protein  25.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2920  hypothetical protein  25.7 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4236  transport-associated protein  36.36 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3264  putative signal peptide protein  27.13 
 
 		 271 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1679  transport-associated protein  38.03 
 
 		 118 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.3238  normal  0.893681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4342  hypothetical protein  35.21 
 
 		 131 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5023  hypothetical protein  35.21 
 
 		 125 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5837  hypothetical protein  35.21 
 
 		 125 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4706  transport-associated  30 
 
 		 116 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.275207  normal  0.0404063 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 279 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5453  transport-associated protein  34.85 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.627587  hitchhiker  0.00543554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5211  transport-associated  37.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0618952  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0262  transport-associated protein  32.14 
 
 		 279 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5879  transport-associated  36 
 
 		 115 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5648  transport-associated  37.18 
 
 		 123 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0978596  normal  0.176508 
 
 
-
 
NC_002978  WD0321  hypothetical protein  29.73 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0139  transport-associated protein  36.51 
 
 		 223 aa  42.4  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0407  transport-associated  28.12 
 
 		 265 aa  42.4  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3885  transport-associated  38.36 
 
 		 135 aa  41.6  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.225437 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>