227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0561 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0561  phosphoglyceromutase  100 
 
 		 521 aa  1061    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00179134  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1757  phosphoglyceromutase  57.43 
 
 		 513 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000493891  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0439  phosphoglyceromutase  57.76 
 
 		 557 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.156638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1516  phosphoglyceromutase  58.55 
 
 		 511 aa  586  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0683605  decreased coverage  0.000804177 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1141  phosphoglyceromutase  55.11 
 
 		 524 aa  565  1e-160  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000850131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0093  phosphoglyceromutase  54.17 
 
 		 511 aa  565  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.784712  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0799  phosphoglyceromutase  54.83 
 
 		 510 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.862146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2574  phosphoglyceromutase  54.96 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.597659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  54.74 
 
 		 510 aa  527  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3594  phosphoglyceromutase  50.78 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3207  phosphoglyceromutase  55.25 
 
 		 513 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00207704  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3203  phosphoglyceromutase  53.86 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000345113  unclonable  3.7174500000000003e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  51.78 
 
 		 512 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  52.16 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  52.35 
 
 		 516 aa  515  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0309  phosphoglyceromutase  53.62 
 
 		 514 aa  513  1e-144  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0235931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3774  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 		 512 aa  514  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000507492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3858  phosphoglyceromutase  51.09 
 
 		 512 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0805243 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1837  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  53.85 
 
 		 510 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.906856  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0822  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 523 aa  499  1e-140  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  48.66 
 
 		 525 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 513 aa  499  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1702  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.98 
 
 		 511 aa  501  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  52.56 
 
 		 516 aa  500  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  52.56 
 
 		 513 aa  498  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0723  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 533 aa  496  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.191053  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  52.05 
 
 		 519 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  50 
 
 		 514 aa  495  1e-139  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  50.59 
 
 		 513 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0656  phosphoglyceromutase  51.07 
 
 		 524 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  51.78 
 
 		 509 aa  490  1e-137  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3023  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 516 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.634479  decreased coverage  0.00447978 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1914  phosphoglyceromutase  49.02 
 
 		 518 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2757  phosphoglyceromutase  51.68 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.263811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3731  phosphoglyceromutase  49.11 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  48.32 
 
 		 512 aa  490  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2546  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  50.47 
 
 		 532 aa  490  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  49.7 
 
 		 509 aa  486  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  49.21 
 
 		 517 aa  486  1e-136  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0743  phosphoglyceromutase  50.49 
 
 		 521 aa  486  1e-136  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4623  phosphoglyceromutase  52.84 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.947003  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  47.83 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  50.29 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0905  phosphoglyceromutase  53.06 
 
 		 505 aa  484  1e-135  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.835251  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 512 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 511 aa  479  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1234  phosphoglyceromutase  51.87 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.774717  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  50.98 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 514 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  48.53 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2981  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 		 506 aa  480  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0726522 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0563  phosphoglyceromutase  47.84 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0539  phosphoglyceromutase  47.65 
 
 		 514 aa  478  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  48.92 
 
 		 511 aa  477  1e-133  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4375  phosphoglyceromutase  49.12 
 
 		 510 aa  475  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  49.31 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  48.43 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  48.72 
 
 		 514 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  48.62 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4040  phosphoglyceromutase  49.72 
 
 		 532 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.010334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  49.81 
 
 		 508 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  50.68 
 
 		 525 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  48.52 
 
 		 514 aa  473  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1764  phosphoglyceromutase  46.53 
 
 		 505 aa  474  1e-132  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0934  phosphoglyceromutase  52.36 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2264  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4527  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  51.2 
 
 		 515 aa  468  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  47.64 
 
 		 511 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  50.1 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0379  phosphoglyceromutase  50.39 
 
 		 504 aa  468  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  47.44 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1011  phosphoglyceromutase  47.72 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  48.32 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  50.2 
 
 		 511 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  50.3 
 
 		 515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  48.32 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  48.23 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2506  phosphoglyceromutase  51.58 
 
 		 507 aa  469  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  48.82 
 
 		 513 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1196  phosphoglyceromutase  47.33 
 
 		 506 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  47.34 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2593  phosphoglyceromutase  52.36 
 
 		 506 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.721523  normal  0.885019 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2315  phosphoglyceromutase  47.96 
 
 		 532 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.619962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>