71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0263 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0263  Gp5 domain protein  100 
 
 		 360 aa  720    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.791542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1446  Gp5 domain-containing protein  59.2 
 
 		 359 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2743  Gp5 domain-containing protein  59.2 
 
 		 359 aa  346  5e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.724798 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0680  Gp5 domain-containing protein  38.06 
 
 		 323 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.736805  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5076  Gp5 domain-containing protein  37.65 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1049  hypothetical protein, putative phage gene  32.37 
 
 		 541 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1032  hypothetical protein  35.14 
 
 		 543 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3470  phage protein  37.18 
 
 		 567 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000394685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2914  phage protein  36.84 
 
 		 567 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000301579 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2779  phage protein  37.18 
 
 		 567 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00246067  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0926  hypothetical protein  39.43 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0722  hypothetical protein  32.52 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0918  hypothetical protein  35.63 
 
 		 551 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0564  hypothetical protein  32.64 
 
 		 364 aa  131  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.636902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0743  hypothetical protein  33.76 
 
 		 231 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.104766 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05049  hypothetical protein  36.2 
 
 		 232 aa  113  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4921  hypothetical protein  43.44 
 
 		 125 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1306  hypothetical protein  29.24 
 
 		 178 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4920  hypothetical protein  31.67 
 
 		 197 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0250  type VI secretion system Vgr family protein  28.3 
 
 		 794 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3654  baseplate assembly protein, putative  24.4 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3389  baseplate assembly protein, putative  33.09 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  27.08 
 
 		 661 aa  55.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1305  hypothetical protein  42.11 
 
 		 58 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2825  type VI secretion system Vgr family protein  26.27 
 
 		 678 aa  53.9  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3238  type VI secretion system Vgr family protein  26.67 
 
 		 678 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0531  type VI secretion system Vgr family protein  26.46 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2557  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 726 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482945  normal  0.0643046 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3386  vgrG protein  24.11 
 
 		 725 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.160309  normal  0.824381 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  24.18 
 
 		 668 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1581  Rhs element Vgr protein  26.54 
 
 		 757 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.206829 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2614  vgrG protein  23.32 
 
 		 722 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0110775 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  25 
 
 		 741 aa  47  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2513  type VI secretion system Vgr family protein  25.34 
 
 		 682 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  24.9 
 
 		 668 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2014  type VI secretion system Vgr family protein  27.72 
 
 		 753 aa  46.6  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758033  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2439  type VI secretion system Vgr family protein  27.27 
 
 		 712 aa  46.2  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2371  Rhs element Vgr protein  23.72 
 
 		 725 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2117  Rhs element Vgr protein  23.11 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2094  Rhs element Vgr protein  27.85 
 
 		 646 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.730907  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  24.89 
 
 		 767 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2151  Rhs element Vgr protein  26.87 
 
 		 706 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  24.67 
 
 		 668 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  24.89 
 
 		 767 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  31.48 
 
 		 211 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  24.63 
 
 		 741 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  23.39 
 
 		 703 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  25.23 
 
 		 741 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1195  ribosomal protein L7/L12  21.36 
 
 		 860 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.191109  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1301  baseplate assembly protein, putative  27.56 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000120428 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1193  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 731 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.598361  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0265  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 731 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3719  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 723 aa  43.5  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.331309  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0410  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.447319  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1607  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1790  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129982  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2953  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.527761  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2828  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0460  Rhs element Vgr protein  26.42 
 
 		 734 aa  43.1  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141236  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  25.36 
 
 		 741 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3234  type VI secretion system Vgr family protein  20.94 
 
 		 722 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  22.87 
 
 		 669 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3024  Rhs element Vgr protein  23.64 
 
 		 725 aa  42.7  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.130505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1212  Rhs element Vgr protein  25.99 
 
 		 699 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>