More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2161 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2161  M48 family peptidase  100 
 
 
319 aa  621  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.117375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1109  peptidase M48 Ste24p  50.97 
 
 
316 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3388  peptidase M48, Ste24p  47.1 
 
 
321 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.580717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2307  peptidase M48 Ste24p  46.28 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.80067  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1159  peptidase M48, Ste24p  46.77 
 
 
330 aa  232  6e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.800852  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1572  peptidase M48, Ste24p  47.02 
 
 
321 aa  230  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0369731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2125  peptidase M48 Ste24p  46.8 
 
 
321 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.438964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1189  M48 family peptidase  43.91 
 
 
316 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3419  M48 family peptidase  46.13 
 
 
321 aa  225  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2025  peptidase M48, Ste24p  43.31 
 
 
331 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1347  peptidase M48, Ste24p  42.99 
 
 
331 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0615  peptidase M48 Ste24p  44.98 
 
 
321 aa  218  2e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.456221 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2090  peptidase, M48 family  40.66 
 
 
313 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.750108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1746  peptidase M48 Ste24p  40.66 
 
 
313 aa  211  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0403814 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0550  peptidase M48, Ste24p  46.64 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111224  hitchhiker  0.000685089 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0093  M48 family peptidase  34.28 
 
 
279 aa  134  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.500994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3406  M48 family peptidase  33.45 
 
 
306 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.3096  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0071  heat shock protein HtpX  32.78 
 
 
343 aa  133  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000193104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0023  M48 family peptidase  33.1 
 
 
280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0312  M48 family peptidase  33.45 
 
 
285 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.632212  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0244  M48 family peptidase  35.29 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0185  M48 family peptidase  33.22 
 
 
279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0285  M48 family peptidase  33.68 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.543465  normal  0.0172766 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4413  M48 family peptidase  33.8 
 
 
296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.631317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3563  M48 family peptidase  33.45 
 
 
286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0243  M48 family peptidase  34.95 
 
 
280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3062  M48 family peptidase  33.56 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2923  heat shock protein HtpX  35.69 
 
 
298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3179  M48 family peptidase  33.56 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1327  peptidase M48 Ste24p  34.02 
 
 
287 aa  126  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.533301  hitchhiker  0.000000000342604 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0908  heat shock protein HtpX  37.41 
 
 
280 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.906827 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3276  peptidase M48 Ste24p  35.29 
 
 
285 aa  126  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0502019  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3352  M48 family peptidase  33.1 
 
 
286 aa  125  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3675  M48 family peptidase  32.75 
 
 
286 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3384  peptidase M48 Ste24p  35.31 
 
 
283 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.414288 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4635  heat shock protein HtpX  33.11 
 
 
316 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3417  heat shock protein HtpX  32.26 
 
 
313 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3140  M48 family peptidase  32.87 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.911826  normal  0.757645 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0074  M48 family peptidase  33.45 
 
 
286 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.123585  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0189  heat shock protein HtpX  33.1 
 
 
307 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.160092  normal  0.264945 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6475  M48 family peptidase  32.2 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0131  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2510  M48 family peptidase  32.87 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3124  M48 family peptidase  32.87 
 
 
285 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.840919  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0145  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2802  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0349  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0154  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.438309  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2278  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.564612  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0163  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3121  M48 family peptidase  32.06 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2356  M48 family peptidase  31.86 
 
 
285 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3393  heat shock protein HtpX  34.96 
 
 
291 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.892823  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0038  M48 family peptidase  31.83 
 
 
285 aa  122  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1939  peptidase M48, Ste24p  33.8 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4296  protease heat shock protein  32.34 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0368  peptidase M48 Ste24p  31.35 
 
 
282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00001732  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0558  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 
285 aa  119  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.363188 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3918  heat shock protein HtpX  32.48 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.03163  normal  0.594481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4243  heat shock protein HtpX  32.86 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.123521 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4360  heat shock protein HtpX  32.69 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0088  heat shock protein HtpX  33.21 
 
 
289 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.565985  normal  0.068582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0421  peptidase M48, Ste24p  33.09 
 
 
279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000540856  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1051  HtpX-2 peptidase  34.32 
 
 
283 aa  116  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000114749  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3579  heat shock protein HtpX  31.83 
 
 
293 aa  116  5e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.421936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1819  peptidase M48 Ste24p  34.63 
 
 
283 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.376648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2930  peptidase M48 Ste24p  35.16 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4377  peptidase M48 Ste24p  35.17 
 
 
284 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1982  peptidase M48, Ste24p  34 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.333894  normal  0.247951 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0554  peptidase M48 Ste24p  34.57 
 
 
285 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000177743  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1445  peptidase M48  32.83 
 
 
289 aa  115  8.999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4120  peptidase M48 Ste24p  34.65 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1269  peptidase M48, Ste24p  34.51 
 
 
282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3192  heat shock protein HtpX  32.11 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.349199  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1776  M48 family peptidase  30.59 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1928  peptidase M48, Ste24p  34.83 
 
 
296 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.987117  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0557  heat shock protein HtpX  32.39 
 
 
290 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1082  HtpX-2 peptidase  32.5 
 
 
285 aa  114  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2841  HtpX-2 peptidase  37.44 
 
 
307 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2697  peptidase M48 Ste24p  35.37 
 
 
289 aa  112  6e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3260  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 
294 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.741815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0034  heat shock protein HtpX  31.62 
 
 
317 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.900094 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3025  peptidase M48 Ste24p  37.44 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0233  peptidase M48 Ste24p  33.46 
 
 
281 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.427677  normal  0.471539 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0774  heat shock protein HtpX  32.21 
 
 
315 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0890  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000209809  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0750  peptidase M48, Ste24p  32.98 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0193162  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1627  heat shock protein HtpX  30.8 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.384768  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0879  M48 family peptidase  31.65 
 
 
288 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.631833  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0237  heat shock protein HtpX  31.51 
 
 
307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0144  HtpX-2 peptidase  32.1 
 
 
281 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.824625 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0889  HtpX-2 peptidase  32.08 
 
 
287 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1349  heat shock protein htpX  31.86 
 
 
312 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0694  peptidase M48, Ste24p  35.64 
 
 
292 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264807  normal  0.558522 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2779  heat shock protein HtpX  31.76 
 
 
289 aa  109  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0145109 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3569  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 
285 aa  109  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000538861  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4692  heat shock protein HtpX  29.12 
 
 
310 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0946  peptidase M48 Ste24p  34.6 
 
 
285 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.401164 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1232  heat shock protein HtpX  34.03 
 
 
299 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1274  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
279 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>