92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1091 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1091  PTS system, IID component, putative  100 
 
 		 259 aa  522  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2879  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  65.32 
 
 		 259 aa  316  2e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.769403 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2150  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  60.57 
 
 		 316 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2017  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  53.4 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.188482 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3313  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  53.3 
 
 		 248 aa  209  5e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1794  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  40.97 
 
 		 249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0169  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  33.33 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0158  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  33.33 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0151  phosphotransferase system, mannose/fructose/sorbose family IID component  32.8 
 
 		 255 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.64759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0156  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  38.53 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1931  PTS enzyme IID, mannose-specific  27.59 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00168811  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0627  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  28.45 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0686  PTS system mannose-specific enzyme II, D component  28.45 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0449  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  28.97 
 
 		 279 aa  57  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.519289  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1865  mannose-specific PTS system component IID  27.68 
 
 		 307 aa  54.7  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0115202  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0607  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.19 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0447988  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4893  fructose permease iid component  28.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2466  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.35 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.413295  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4946  fructose-specific PTS system IID component  28.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4952  fructose permease iid component  28.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.142338  normal  0.182639 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2370  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.35 
 
 		 292 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4792  fructose permease iid component  28.57 
 
 		 282 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.519227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0359  PTS system, mannose-specific IID component  28.16 
 
 		 303 aa  52  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0670876  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1064  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  28.77 
 
 		 359 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.309929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0466  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID subunit  26.79 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000766328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2388  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  28.04 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1971  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.447296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2032  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.394524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1975  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.392737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1484  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1300  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.32 
 
 		 283 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3477  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  21.11 
 
 		 282 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0466  mannose-specific PTS system component IID  29.91 
 
 		 304 aa  49.7  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000120497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2815  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  24.06 
 
 		 280 aa  49.3  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00404661 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0202  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  30.11 
 
 		 312 aa  49.3  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000169297  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1793  mannose-specific PTS system component IID  25 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000964507  unclonable  8.06003e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1766  mannose-specific PTS system component IID  25.89 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0151  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.47 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3575  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  27.52 
 
 		 292 aa  48.5  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.866919 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0516  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID  26.71 
 
 		 283 aa  48.1  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000200436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0820  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID subunit  25 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0370  mannose PTS system component IID  26.21 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.27147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01777  hypothetical protein  27.1 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4592  fructose permease iid component  25.19 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3400  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  23.67 
 
 		 271 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1824  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID subunit  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2548  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0049977  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01789  mannose-specific enzyme IID component of PTS  27.1 
 
 		 286 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2085  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1369  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0151358  normal  0.0150723 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1813  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17929  normal  0.360309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1981  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.36 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.880125  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3949  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  25.22 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2047  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000021025  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1909  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  27.1 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0806  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID subunit  25 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1924  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  26.42 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2217  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  26.42 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0287327  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0949  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  24.05 
 
 		 272 aa  46.2  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.64503  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2023  PTS system mannose-specific transporter subunit IID  25.47 
 
 		 279 aa  46.2  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3581  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  46.2  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.208076 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2389  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  28.19 
 
 		 291 aa  45.8  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02951  hypothetical protein  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03000  PTS system, N-acetylgalactosamine-specific IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4449  PTS system N-acetylgalactosamine-specific, IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.340341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1898  PTS system, IID component  26.19 
 
 		 271 aa  45.8  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.2311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0211  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID subunit  23.94 
 
 		 286 aa  45.8  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3432  PTS system N-acetylgalactosamine-specific, IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0565  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3325  PTS system N-acetylgalactosamine-specific, IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3332  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.40145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03007  N-acetylgalactosamine-specific enzyme IID component of PTS  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0565  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID subunit  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4457  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3615  PTS system N-acetylgalactosamine-specific, IID component  26.71 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.811121  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3622  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0558  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.939682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02958  hypothetical protein  26.59 
 
 		 263 aa  45.4  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3845  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.61 
 
 		 297 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1270  phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID  30.77 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.412312  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0347  PTS system, IID component  26.17 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1299  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID subunit  24.11 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3426  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  26.6 
 
 		 277 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000388763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2966  PTS system, IID component  23.85 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4517  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID component  22.4 
 
 		 384 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4278  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  27.48 
 
 		 273 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4477  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID subunit  22.95 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.419116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5494  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IID component  22.4 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3208  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  27 
 
 		 274 aa  42.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3439  PTS system N-acetylgalactosamine-specific transporter subunit IID  26.59 
 
 		 263 aa  42  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1314  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  27.08 
 
 		 272 aa  42  0.01  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.174482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2099  PTS system mannose/fructose/sorbose family IID component  25.73 
 
 		 270 aa  42  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>