More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2740 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2740  GTP-binding protein Era  100 
 
 		 305 aa  619  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3591  GTP-binding protein Era  49.01 
 
 		 308 aa  324  1e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2207  GTP-binding protein Era  50.5 
 
 		 307 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.547377 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2909  GTP-binding protein Era  49.17 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000618187  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0371  GTP-binding protein Era  50.5 
 
 		 307 aa  315  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0084  GTP-binding protein Era  52.67 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  43 
 
 		 314 aa  262  6e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2226  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 299 aa  261  1e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2127  GTP-binding protein Era  43.48 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.148937  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2315  GTP-binding protein Era  42.62 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0908  GTP-binding protein Era  46.71 
 
 		 303 aa  252  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  43.56 
 
 		 329 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1711  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 307 aa  248  7e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000444879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2421  GTP-binding protein Era  40.42 
 
 		 302 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  41.72 
 
 		 321 aa  246  4e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03535  GTP-binding protein Era  40.94 
 
 		 320 aa  245  8e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 339 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002498  GTP-binding protein Era  41.28 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 332 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3150  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0326426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1726  GTP-binding protein Era  43.1 
 
 		 296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  42.67 
 
 		 300 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1062  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 297 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3553700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1029  GTP-binding protein Era  41.81 
 
 		 302 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  43.05 
 
 		 335 aa  242  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12510  GTP-binding protein Era  40 
 
 		 294 aa  242  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 314 aa  242  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 303 aa  242  7e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 334 aa  241  9e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1405  GTP-binding protein Era  39.53 
 
 		 303 aa  240  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00334874  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  42.24 
 
 		 338 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  42.72 
 
 		 331 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 311 aa  239  2.9999999999999997e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  43.62 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  42.57 
 
 		 330 aa  239  5e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  42.86 
 
 		 315 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  39.06 
 
 		 311 aa  238  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2038  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 324 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.655908  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3066  GTP-binding protein Era  39.26 
 
 		 300 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000674548  decreased coverage  0.0000000895367 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  41.25 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  41.61 
 
 		 302 aa  236  3e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0874  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0951  GTP-binding protein Era  42.05 
 
 		 305 aa  235  8e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3726  GTP-binding protein Era  42.81 
 
 		 340 aa  235  9e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.244142  normal  0.251603 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  41.33 
 
 		 301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2242  GTP-binding protein Era  42 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709672 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  42.3 
 
 		 300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1499  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030246  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0397  GTP-binding protein Era  38.94 
 
 		 303 aa  233  3e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1981  GTP-binding protein Era  38.67 
 
 		 298 aa  232  5e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  42.42 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  41 
 
 		 301 aa  232  5e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  40.6 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1122  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1401  GTP-binding protein Era  41.95 
 
 		 304 aa  232  6e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.38298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  41.39 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  39.39 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  40.27 
 
 		 301 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  40.53 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  229  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3026  GTP-binding protein Era  38.13 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.552288  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  42.33 
 
 		 301 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  42.09 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4151  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  229  6e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54320  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 305 aa  228  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2875  GTP-binding protein Era  42.28 
 
 		 318 aa  228  8e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4748  GTP-binding protein Era  41.53 
 
 		 302 aa  228  8e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0521069  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  42.14 
 
 		 309 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0579  GTP-binding protein Era  38.13 
 
 		 298 aa  227  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  39.93 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1116  GTP-binding protein Era  39.6 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4417  GTP-binding protein Era  38.46 
 
 		 301 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1118  GTP-binding protein Era  38.87 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0819  GTP-binding protein Era  38.13 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000201776  decreased coverage  1.20434e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4380  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000332799  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4037  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4047  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000669103  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4322  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.08796e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4433  GTP-binding protein Era  37.79 
 
 		 301 aa  225  6e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109784  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  40.33 
 
 		 305 aa  225  9e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0668  GTP-binding protein Era  37.95 
 
 		 299 aa  225  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0548419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>