227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1682 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1682  aspartate 1-decarboxylase  100 
 
 		 116 aa  239  1e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1013  aspartate 1-decarboxylase  61.74 
 
 		 126 aa  156  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.354884  normal  0.0946421 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0199  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 114 aa  114  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2731  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3120  aspartate alpha-decarboxylase  49.57 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2560  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2970  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1979  aspartate 1-decarboxylase  48.65 
 
 		 128 aa  111  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2856  aspartate alpha-decarboxylase  46.09 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1158  aspartate alpha-decarboxylase  48.7 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0625401  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0679  aspartate alpha-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.588741  normal  0.624276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0377  aspartate 1-decarboxylase  48.7 
 
 		 131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.181374  normal  0.0242417 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4194  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4167  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2825  aspartate alpha-decarboxylase  48.28 
 
 		 126 aa  110  5e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.359924  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4051  L-aspartate 1-decarboxylase  49.11 
 
 		 131 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0774  aspartate 1-decarboxylase  51.82 
 
 		 125 aa  110  7.000000000000001e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1785  aspartate alpha-decarboxylase  49.12 
 
 		 128 aa  110  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.198909  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1263  aspartate 1-decarboxylase  50 
 
 		 126 aa  110  8.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.833661 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1026  aspartate alpha-decarboxylase  48.28 
 
 		 126 aa  110  9e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0260432  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2996  aspartate alpha-decarboxylase  45.22 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00130  aspartate 1-decarboxylase precursor  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3471  aspartate 1-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00129  hypothetical protein  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.205185  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0141  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0074  aspartate alpha-decarboxylase  46.85 
 
 		 115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000187496  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0133  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0124  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3528  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0135  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0139  aspartate alpha-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0936  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 127 aa  107  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0700  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.396068  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1203  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.85801  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0212  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0197  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2313  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0360595  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2974  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1048  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1625  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 128 aa  107  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00269652  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0214  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.112461  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0726  aspartate alpha-decarboxylase  48.7 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00148061  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0200  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.35681  normal  0.607126 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0196  aspartate alpha-decarboxylase  47.41 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1062  aspartate 1-decarboxylase  47.37 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0877  Aspartate 1-decarboxylase  49.14 
 
 		 126 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.470922  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1042  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 128 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3013  aspartate alpha-decarboxylase  45.54 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.128431 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0334  aspartate alpha-decarboxylase  43.64 
 
 		 121 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0901  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12570  L-aspartate 1-decarboxylase  52.21 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.521222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1937  aspartate 1-decarboxylase  46.9 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0578  aspartate 1-decarboxylase  46.09 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2657  aspartate 1-decarboxylase  45.13 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1739  aspartate alpha-decarboxylase  46.36 
 
 		 115 aa  105  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00356963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0386  aspartate 1-decarboxylase  49.57 
 
 		 125 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000166101  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62600  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_706  aspartate 1-decarboxylase  47.83 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.455647  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3993  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0802  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000217258  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0847  aspartate alpha-decarboxylase  46.55 
 
 		 128 aa  104  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.664806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3494  aspartate alpha-decarboxylase  47.27 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2817  aspartate alpha-decarboxylase  47.27 
 
 		 126 aa  104  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.186464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42730  aspartate alpha-decarboxylase  44.25 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5448  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 126 aa  103  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1422  aspartate alpha-decarboxylase  51.82 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.200169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3032  aspartate alpha-decarboxylase  43.36 
 
 		 135 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3067  aspartate alpha-decarboxylase  46.9 
 
 		 126 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.439202  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1832  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.474375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2448  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2443  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3536  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 118 aa  102  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.620572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2198  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 128 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  0.631092 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3474  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3345  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000505092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1013  aspartate alpha-decarboxylase  45.69 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1835  aspartate alpha-decarboxylase  45.95 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3569  aspartate alpha-decarboxylase  49.11 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0673  aspartate alpha-decarboxylase  44.25 
 
 		 126 aa  101  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5774  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.941692  normal  0.354214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0851  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2490  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1009  aspartate alpha-decarboxylase  44.83 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2358  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  0.4255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3489  aspartate alpha-decarboxylase  44.83 
 
 		 128 aa  100  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2619  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2673  aspartate alpha-decarboxylase  45.13 
 
 		 127 aa  100  7e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2080  aspartate alpha-decarboxylase  46.43 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.14084  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0594  aspartate alpha-decarboxylase  46.43 
 
 		 126 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.336856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0503  aspartate alpha-decarboxylase  41.74 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1451  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1423  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1424  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2055  aspartate alpha-decarboxylase  47.32 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.552019  normal  0.161743 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1564  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.572975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1635  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0211436 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0566  aspartate alpha-decarboxylase  44.64 
 
 		 126 aa  99.4  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000545672 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1708  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000361196  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0652  aspartate alpha-decarboxylase  45.54 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.573242  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1466  aspartate alpha-decarboxylase  46.02 
 
 		 127 aa  99.4  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>