169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0546 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0546  Glucokinase  100 
 
 
321 aa  651    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.499274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1461  glucokinase  46.08 
 
 
329 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.497227  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0900  Glucokinase  41.94 
 
 
365 aa  207  3e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000532336 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1958  glucokinase  41.36 
 
 
354 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1390  Glucokinase  34.31 
 
 
343 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0110243  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119474  Glucokinase  30.15 
 
 
367 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00149194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2002  glucokinase  32.25 
 
 
327 aa  106  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00689759  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2721  glucokinase  32.25 
 
 
338 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2219  glucokinase  31.83 
 
 
327 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000124092 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1018  glucokinase  29.91 
 
 
321 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22930  glucokinase  32.84 
 
 
331 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.323024 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4213  glucokinase  29.94 
 
 
319 aa  99  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.517181  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1037  glucokinase  30.03 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.744412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0774  glucokinase  28.01 
 
 
351 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1049  glucokinase  31.03 
 
 
319 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531529  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2738  glucokinase  27.64 
 
 
349 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3364  glucokinase  27.64 
 
 
349 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0161  Glucokinase  30.6 
 
 
343 aa  95.9  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2333  glucokinase  27.17 
 
 
353 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00107266 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1691  glucokinase  29.9 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.768605 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04130  glucokinase  30.91 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06611  putative glucokinase  27.4 
 
 
345 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3369  glucokinase  30.36 
 
 
339 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0933  glucokinase  27.78 
 
 
342 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1872  glucokinase  27.08 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1011  glucokinase  30.72 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.35941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1010  glucokinase  31.03 
 
 
320 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.236387  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1743  glucokinase  31.35 
 
 
326 aa  92.8  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000689724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4374  glucokinase  29.6 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568433  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1049  glucokinase  29.26 
 
 
343 aa  92.4  9e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335564  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2486  glucokinase  31.29 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0957431  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06521  putative glucokinase  28.37 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06221  putative glucokinase  28.65 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4908  Glucokinase  30.77 
 
 
333 aa  89.7  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.277219  normal  0.399592 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0306  glucokinase  29.05 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1110  glucokinase  34.88 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.810469  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3296  glucokinase  32.2 
 
 
332 aa  89  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1935  glucokinase  32.63 
 
 
339 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5260  Glucokinase  32.19 
 
 
335 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.744972  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0771  glucokinase  25.51 
 
 
341 aa  89  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15690  glucokinase  30.84 
 
 
322 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331936  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0592  glucokinase  29.34 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.909544 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0987  glucokinase  28.62 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1332  glucokinase  28.62 
 
 
346 aa  87.8  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.866476  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1147  glucokinase  32.51 
 
 
319 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0600671  normal  0.317222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1289  glucokinase  34.42 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5495  glucokinase  29.15 
 
 
333 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2915  glucokinase  28.25 
 
 
334 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2382  glucokinase  26.17 
 
 
321 aa  86.3  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1268  glucokinase  26.42 
 
 
332 aa  85.9  8e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3594  glucokinase  31.19 
 
 
342 aa  85.9  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4862  Glucokinase  30.67 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.255037  normal  0.048255 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4623  glucokinase  29.78 
 
 
326 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4399  glucokinase  30.46 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.189498  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1943  glucokinase  29.69 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3407  glucokinase  26.67 
 
 
320 aa  83.2  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4371  glucokinase  30.38 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1441  glucokinase  29.87 
 
 
329 aa  82.4  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0008  glucokinase  31.25 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3293  glucokinase  30.22 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0024  glucokinase  28.31 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0596  glucokinase  28.08 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.819046  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2757  glucokinase  25.3 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0507  glucokinase  26.22 
 
 
320 aa  80.5  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1032  glucokinase  28.82 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4319  glucokinase  30.18 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197522  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0337  glucokinase  26.71 
 
 
337 aa  80.1  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02298  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1269  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.207294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3620  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.9705 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02259  hypothetical protein  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0221  glucokinase  27.14 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.709861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1281  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.687131 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2525  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2678  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.615325  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0935  glucokinase  29.69 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152699  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5327  glucokinase  29.01 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2540  glucokinase  25.45 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.692132  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1829  glucokinase  29.45 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.404712  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2047  glucokinase  30.67 
 
 
339 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00612333  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0373  glucokinase  27.08 
 
 
337 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10541  putative glucokinase  24.93 
 
 
346 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.237851  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3057  glucokinase  26.28 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.628351  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2636  glucokinase  25.15 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0973  glucokinase  26.97 
 
 
317 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18591  putative glucokinase  28.21 
 
 
353 aa  77.4  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4129  glucokinase  25.78 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.386915  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2546  glucokinase  25.15 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2765  glucokinase  25.15 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2595  glucokinase  25.15 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.28125  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1145  glucokinase  27.36 
 
 
317 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0784786  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2921  glucokinase  25.61 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5799  glucokinase  31.79 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0789427 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2661  glucokinase  24.85 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.077785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4443  glucokinase  25.47 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.862688 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1332  glucokinase  26.89 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1444  glucokinase  26.89 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2728  glucokinase  26.89 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2062  glucokinase  29.47 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.507851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0462  hypothetical protein  25.55 
 
 
335 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>