200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3233 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3233  phenylacetic acid degradation-related protein  100 
 
 		 139 aa  287  4e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.32812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3582  phenylacetic acid degradation-related protein  63.31 
 
 		 143 aa  189  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.728907 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3644  thioesterase superfamily protein  62.59 
 
 		 143 aa  184  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1007  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 		 139 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3491  phenylacetic acid degradation-related protein  56.83 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2200  thioesterase superfamily protein  54.68 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0908  phenylacetic acid degradation-related protein  51.54 
 
 		 137 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0342  thioesterase superfamily protein  57.5 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0707  phenylacetic acid degradation-related protein  53.44 
 
 		 139 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0294  thioesterase superfamily protein  58.88 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.356401  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0275  comA operon protein 2  47.79 
 
 		 139 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2790  thioesterase family protein  47.79 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611974  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1162  thioesterase family protein  47.79 
 
 		 199 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2944  thioesterase family protein  47.06 
 
 		 139 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5184  putative esterase; putative phenylacetic acid degradation-related  41.18 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.365814 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3232  phenylacetic acid degradation-related protein  30.22 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.335401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2347  phenylacetic acid degradation-related protein  35.82 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2446  thioesterase superfamily protein  33.04 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1614  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0333607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2603  hypothetical protein  34.55 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.104103  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5139  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09903  hypothetical protein  29.17 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.229985  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1468  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2224  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00436859  hitchhiker  0.00000299365 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2595  hypothetical protein  30.43 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2754  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2101  thioesterase superfamily protein  32.61 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1740  esterase YdiI  30.43 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1846  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  34.48 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2177  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.554622  hitchhiker  0.00530749 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6229  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.479788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3890  hypothetical protein  34.78 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.483397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2452  thioesterase superfamily protein  27.12 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.139649  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1451  phenylacetic acid degradation-related protein  28.06 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4719  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0114  phenylacetic acid degradation-related protein  27.34 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0328  hypothetical protein  27.13 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2909  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1024  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1589  ComA operon protein (competence protein)  29.57 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0541408  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1083  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  31.9 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  38.54 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  31.9 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1314  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3063  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 139 aa  60.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.530863  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43600  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0351333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3655  hypothetical protein  28.06 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282714  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0069  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1884  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000959247  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4204  phenylacetic acid degradation-like protein  29.79 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517567 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0084  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1660  thioesterase superfamily protein  27.73 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0414266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0958  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1486  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63041  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2463  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0884978  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00564  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3029  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.99639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0499  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00553  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0617  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3047  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0648  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0617  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000180  phenylacetic acid degradation protein  27.64 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0099  hypothetical protein  28.78 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0682  hypothetical protein  31.9 
 
 		 137 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0061  phenylacetic acid degradation-related protein  29.63 
 
 		 140 aa  57  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.518307  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0606  thioesterase superfamily protein  36.63 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0448554 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1692  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.879751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0548  hypothetical protein  28.06 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1031  thioesterase family protein  26.02 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1161  thioesterase  26.02 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5047  putative comA operon protein  26.27 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.766218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03576  esterase YdiI  27.56 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.653311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5054  comA operon protein, putative  26.27 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0187  putative comA operon protein  26.27 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0946  hypothetical protein  28.21 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4737  thioesterase superfamily protein  26.27 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00953247  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1643  hypothetical protein  27.82 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.995297  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0531  putative thioesterase  28.46 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5059  putative comA operon protein  26.27 
 
 		 127 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1045  hypothetical protein  27.64 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1560  thioesterase superfamily protein  37.62 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5026  putative comA operon protein  26.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4785  comA operon protein  26.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00110473  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4625  comA operon protein (competence protein)  26.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000245842  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4647  comA operon protein (competence protein)  26.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0569552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5148  ComA operon protein  26.32 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20230  hypothetical protein  32.17 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.13458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3846  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05030  phenylacetic acid degradation protein  35.42 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.264385  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1129  hypothetical protein  27.41 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.741114 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1545  thioesterase superfamily protein  34.44 
 
 		 126 aa  53.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000739832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0044  hypothetical protein  26.62 
 
 		 140 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338792  normal  0.576658 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05814  esterase  26.83 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>