35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3917 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3917  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  868    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0283416  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5656  hypothetical protein  60.79 
 
 		 418 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5677  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin NimC  58.7 
 
 		 419 aa  362  1e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4506  hypothetical protein  62.59 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.321486 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4374  hypothetical protein  62.59 
 
 		 418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1679  hypothetical protein  35.29 
 
 		 409 aa  239  1e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2803  Outer membrane efflux protein  36.92 
 
 		 414 aa  186  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1463  outer membrane efflux protein  37.74 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00099491  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2707  outer membrane efflux protein  35.14 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0144  hypothetical protein  35.21 
 
 		 420 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.903633 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3710  outer membrane efflux protein  34.93 
 
 		 411 aa  105  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1861  efflux family outer membrane protein  23.2 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1764  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.715826  normal  0.306921 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2628  Outer membrane efflux protein  28.74 
 
 		 432 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.753633 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  24.85 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5982  cation proton antiporter efflux protein CzcC  26.79 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000196082  normal  0.0745476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1641  Outer membrane efflux protein  26.06 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  29.4 
 
 		 449 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0045  CzcC family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter outer membrane protein  27.48 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000529043 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3623  Outer membrane efflux protein  26.27 
 
 		 415 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0062  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000405972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0059  outer membrane efflux protein  27.48 
 
 		 423 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.56854 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1175  outer membrane efflux protein  25.93 
 
 		 416 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0059  outer membrane efflux protein  28.66 
 
 		 394 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00860018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  30.45 
 
 		 432 aa  48.9  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02032  outer membrane protein, probably efflux family  24.64 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1716  outer membrane protein  25.3 
 
 		 440 aa  47  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000584875  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1582  outer membrane efflux protein  29.82 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0904474  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3836  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmvC  32.66 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1089  outer membrane efflux protein  34.48 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4120  heavy metal cation tricomponent efflux outer membrane porin HmyC  27.25 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2106  Outer membrane efflux protein  27.3 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.343125  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6284  outer membrane efflux protein  29.19 
 
 		 430 aa  43.9  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.524439  normal  0.254062 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  29.88 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3802  Outer membrane efflux protein  27.09 
 
 		 465 aa  43.5  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>