More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2905 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2905  monooxygenase FAD-binding  100 
 
 		 381 aa  771    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3162  monooxygenase FAD-binding  70.33 
 
 		 387 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3601  salicylate 1-monooxygenase  68.72 
 
 		 402 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.733205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0481  salicylate 1-monooxygenase  64.41 
 
 		 373 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0813  monooxygenase, FAD-binding  56.73 
 
 		 377 aa  431  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5073  Salicylate 1-monooxygenase  44.53 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926874  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3483  monooxygenase FAD-binding  40.58 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147662 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4324  salicylate 1-monooxygenase  40.58 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524787  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4042  salicylate 1-monooxygenase  40.58 
 
 		 385 aa  258  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00369253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0213  salicylate 1-monooxygenase (NahW)  41.21 
 
 		 403 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00584161  normal  0.918812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2515  salicylate 1-monooxygenase  39.68 
 
 		 386 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193433  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4547  monooxygenase FAD-binding  40.26 
 
 		 385 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.326108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2526  salicylate 1-monooxygenase  37.99 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.066083 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3927  salicylate 1-monooxygenase  38.72 
 
 		 385 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.567277  normal  0.0279633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2140  monooxygenase FAD-binding  39.9 
 
 		 382 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1853  monooxygenase FAD-binding  38.44 
 
 		 385 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3944  salicylate hydroxylase  39.11 
 
 		 382 aa  236  6e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0448295  normal  0.412797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3579  monooxygenase FAD-binding  38.85 
 
 		 382 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.817981 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1893  monooxygenase, FAD-binding  39.11 
 
 		 382 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2311  monooxygenase FAD-binding  38.79 
 
 		 383 aa  228  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0991  salicylate 1-monooxygenase  39.72 
 
 		 397 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0622996  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6042  monooxygenase FAD-binding  37.05 
 
 		 378 aa  225  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0233658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1022  salicylate 1-monooxygenase  37.65 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4207  salicylate 1-monooxygenase  40.91 
 
 		 406 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.880254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2068  salicylate 1-monooxygenase  38.1 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.341777 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4031  DNA mismatch endonuclease Vsr  35.43 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3662  monooxygenase, FAD-binding  34.48 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.555838  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5419  salicylate 1-monooxygenase  39.72 
 
 		 395 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00608306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4129  monooxygenase FAD-binding protein  35.95 
 
 		 421 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2131  salicylate 1-monooxygenase  38.29 
 
 		 400 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1633  monooxygenase FAD-binding  35.45 
 
 		 410 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.719976  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4040  salicylate 1-monooxygenase  33.52 
 
 		 404 aa  188  1e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4498  salicylate 1-monooxygenase  33.81 
 
 		 422 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2584  monooxygenase, FAD-binding  36.84 
 
 		 400 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.613825  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1231  salicylate 1-monooxygenase  33.81 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.592071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4033  monooxygenase FAD-binding  33.81 
 
 		 404 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3149  salicylate 1-monooxygenase  36.29 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2182  monooxygenase, FAD-binding  39.66 
 
 		 412 aa  178  1e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2128  salicylate hydroxylase  35.8 
 
 		 397 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.453627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6859  FAD dependent oxidoreductase  34.2 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.87929 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2160  monooxygenase FAD-binding  36 
 
 		 395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6277  monooxygenase FAD-binding  32.35 
 
 		 405 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146167  normal  0.672282 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0546  monooxygenase, FAD-binding  36.8 
 
 		 373 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0982  monooxygenase FAD-binding  37.12 
 
 		 399 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0183396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3591  salicylate 1-monooxygenase  36.21 
 
 		 398 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3292  salicylate 1-monooxygenase  36.71 
 
 		 404 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0110847 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0896  monooxygenase, FAD-binding  36.57 
 
 		 389 aa  166  9e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0923  monooxygenase FAD-binding  36.09 
 
 		 412 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.264093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2414  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.285012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2522  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 397 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2365  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.602992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2410  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.228446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2321  salicylate hydroxylase  32.94 
 
 		 397 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2480  monooxygenase FAD-binding  34.79 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5237  putative salicylate 1-monooxygenase  37.4 
 
 		 399 aa  159  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.192496 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20710  2-polyprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase-like oxidoreductase  32.57 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.336211  normal  0.159251 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3267  salicylate hydroxylase  32.35 
 
 		 397 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.128222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3231  monooxygenase FAD-binding  35.29 
 
 		 400 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3586  salicylate 1-monooxygenase  33.6 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.942873 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2203  monooxygenase FAD-binding  35.34 
 
 		 395 aa  156  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0588  monooxygenase FAD-binding  34.38 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3144  salicylate hydroxylase  34.73 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.403778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1886  salicylate hydroxylase  33.24 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.499924 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56402  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.77 
 
 		 426 aa  155  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.476468  normal  0.198075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2908  salicylate hydroxylase  33.33 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.511935 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4439  salicylate hydroxylase  33.52 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0982291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3311  monooxygenase, FAD-binding  36.23 
 
 		 401 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2055  monooxygenase, FAD-binding  31.81 
 
 		 416 aa  152  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.6459  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3920  monooxygenase FAD-binding  37.06 
 
 		 397 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31126  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  30.66 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1154  monooxygenase, FAD-binding  35.77 
 
 		 412 aa  150  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3371  salicylate hydroxylase  32.65 
 
 		 402 aa  149  8e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0591709  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1146  monooxygenase, FAD-binding  35.67 
 
 		 414 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263204  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02114  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05260)  31.41 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1067  monooxygenase FAD-binding  35.67 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4148  salicylate hydroxylase  32.65 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0202605  normal  0.0490833 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4218  salicylate hydroxylase  32.65 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.820412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3703  salicylate hydroxylase  33.83 
 
 		 402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0229464  normal  0.0740994 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1885  putative salicylate hydroxylase  33.7 
 
 		 389 aa  147  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.122899  normal  0.226674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0052  monooxygenase, FAD-binding  30.73 
 
 		 413 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0355  salicylate hydroxylase  33.14 
 
 		 427 aa  146  5e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1445  monooxygenase FAD-binding  35.28 
 
 		 394 aa  145  9e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2680  monooxygenase, FAD-binding  34.63 
 
 		 384 aa  145  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.156834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3669  salicylate hydroxylase  32.93 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1193  monooxygenase, FAD-binding  32.96 
 
 		 390 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.155257  normal  0.524756 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1313  monooxygenase, FAD-binding  32.58 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2656  putative salicylate hydroxylase (salicylate 1-monooxygenase)  32.58 
 
 		 391 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0762  monooxygenase FAD-binding  30.75 
 
 		 421 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121092 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50409  Salicylate hydroxylase (Salicylate 1-monooxygenase)  29.83 
 
 		 447 aa  142  7e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0406434 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1110  monooxygenase FAD-binding  32.87 
 
 		 389 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7504  normal  0.659993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3612  monooxygenase FAD-binding  34.25 
 
 		 430 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0302868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3566  monooxygenase, FAD-binding  38.11 
 
 		 389 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411114  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06742  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00590)  33.06 
 
 		 697 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00748094 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03569  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G10180)  31 
 
 		 711 aa  140  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2253  monooxygenase FAD-binding protein  30.41 
 
 		 401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2621  monooxygenase, FAD-binding  34.97 
 
 		 388 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.684205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5387  hypothetical protein  33.33 
 
 		 420 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0881  hypothetical protein  33.95 
 
 		 402 aa  139  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5861  salicylate hydroxylase  32.14 
 
 		 404 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09400  hypothetical protein  34.22 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>