More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0530 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0860  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.27 
 
 
849 aa  650    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  100 
 
 
885 aa  1755    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000016747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5028  flavodoxin/nitric oxide synthase  50.4 
 
 
849 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4243  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:PepSY-associated TM helix:flavodoxin/nitric oxide synthase  45.19 
 
 
840 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0903  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.81 
 
 
850 aa  647    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127756  hitchhiker  0.00576689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4318  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.89 
 
 
851 aa  663    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140327 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4788  flavodoxin/nitric oxide synthase  51.71 
 
 
892 aa  726    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0890  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.98 
 
 
850 aa  647    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.208883  normal  0.710482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5127  oxidoreductase  44.29 
 
 
850 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58560  oxidoreductase  44.52 
 
 
850 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0793  flavodoxin/nitric oxide synthase  44.43 
 
 
843 aa  631  1e-179  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0797  flavodoxin/nitric oxide synthase  41.88 
 
 
842 aa  625  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.292991 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4569  iron-uptake factor  43.47 
 
 
822 aa  594  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02819  iron-uptake factor  42.52 
 
 
844 aa  565  1.0000000000000001e-159  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3632  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.15 
 
 
840 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.732599 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12440  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component/ iron-regulated membrane protein  38.25 
 
 
783 aa  449  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91057  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0578  flavodoxin/nitric oxide synthase  35.43 
 
 
844 aa  435  1e-120  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.142303  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5211  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:flavodoxin/nitric oxide synthase  50.72 
 
 
511 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0428  flavodoxin/nitric oxide synthase  46.22 
 
 
526 aa  358  2.9999999999999997e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5636  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  47.08 
 
 
533 aa  357  6.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.926538  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3992  flavodoxin/nitric oxide synthase  47.3 
 
 
521 aa  344  5e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.968504 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3726  putative oxidoreductase  46.27 
 
 
466 aa  327  7e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.388921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0983  flavodoxin/nitric oxide synthase  43.61 
 
 
534 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.143513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5053  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.83 
 
 
461 aa  311  2.9999999999999997e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.183629  normal  0.101243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12370  sulfite reductase, NADPH flavoprotein alpha-component  43.54 
 
 
513 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0007  PepSY-associated TM helix domain protein  38.5 
 
 
381 aa  238  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4265  PepSY-associated TM helix domain protein  37.66 
 
 
380 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.312937 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4375  PepSY-associated TM helix domain protein  37.66 
 
 
380 aa  231  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.170457 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1565  PepSY-associated TM helix domain protein  34.42 
 
 
381 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1259  molybdopterin oxidoreductase  34.72 
 
 
1257 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.804791  normal  0.0187222 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1302  molybdopterin oxidoreductase  34.27 
 
 
1338 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791008 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1969  molybdopterin oxidoreductase  34.06 
 
 
1313 aa  198  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.784598  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1703  molybdopterin oxidoreductase  33.58 
 
 
1357 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.2815 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0590  sulphite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.73 
 
 
613 aa  189  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.257613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4016  molybdopterin oxidoreductase  32.46 
 
 
1341 aa  185  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.115945  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2200  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.42 
 
 
607 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2720  flavodoxin/nitric oxide synthase  31.62 
 
 
588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.893392  unclonable  0.0000000000726752 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3121  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha component  31.62 
 
 
588 aa  184  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.500128  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4238  PepSY-associated TM helix  33.77 
 
 
397 aa  183  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.593429 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2696  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  31.53 
 
 
600 aa  183  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0776  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.23 
 
 
594 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0682  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.69 
 
 
613 aa  181  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2839  sulfite reductase subunit alpha  29.64 
 
 
602 aa  180  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3807  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.52 
 
 
591 aa  179  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0251884 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1985  molybdopterin oxidoreductase  31.27 
 
 
1403 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279834 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  30.51 
 
 
883 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1491  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 
1370 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5020  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 
1396 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1331  molybdopterin oxidoreductase  33.15 
 
 
1342 aa  172  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0643917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2191  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein alpha-component  24.87 
 
 
614 aa  171  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1381  molybdopterin oxidoreductase  29.65 
 
 
1232 aa  170  9e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5661  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 
1400 aa  170  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6053  hypothetical protein  34.52 
 
 
388 aa  170  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3078  sulfite reductase subunit alpha  29.26 
 
 
599 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282259  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00005  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein subunit alpha  29.76 
 
 
631 aa  168  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4149  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 
1405 aa  168  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.059871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3159  sulfite reductase subunit alpha  28.89 
 
 
599 aa  167  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.87087  normal  0.534662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3767  sulfite reductase alpha subunit (flavoprotein)-like protein  27.78 
 
 
969 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4398  molybdopterin oxidoreductase  30.93 
 
 
1397 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0909646  normal  0.0233897 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3143  sulfite reductase subunit alpha  29.07 
 
 
599 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.49504  normal  0.285573 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2698  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.98 
 
 
626 aa  165  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3064  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  28.19 
 
 
599 aa  165  3e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.286269  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2643  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  25.98 
 
 
629 aa  165  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3102  sulfite reductase subunit alpha  28.7 
 
 
599 aa  164  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271703  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1172  nitrate reductase  31.56 
 
 
1427 aa  163  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0614569  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2398  PepSY-associated TM helix domain protein  34.65 
 
 
398 aa  163  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3434  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.94 
 
 
600 aa  164  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417124 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0340  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.99 
 
 
1418 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.270767  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1084  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.99 
 
 
1418 aa  163  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1752  nitrate reductase, putative  30.99 
 
 
1418 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0512469  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1247  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.99 
 
 
1418 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.845678  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0080  putative nitrate reductase/sulfite reductase flavoprotein alpha-component  30.99 
 
 
1418 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567377  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1663  nitrate reductase, putative  30.99 
 
 
1418 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0241  FdhF  30.99 
 
 
1398 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.322572  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3934  molybdopterin oxidoreductase  30.74 
 
 
1397 aa  162  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002350  sulfite reductase [NADPH] flavoprotein alpha-component  28.86 
 
 
623 aa  162  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4039  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.78 
 
 
610 aa  161  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2904  sulfite reductase subunit alpha  27.78 
 
 
599 aa  161  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4122  molybdopterin oxidoreductase  31.56 
 
 
1405 aa  161  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0706903  normal  0.0956254 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5483  flavodoxin/nitric oxide synthase  29.18 
 
 
589 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0248188  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3260  sulfite reductase subunit alpha  28.52 
 
 
599 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.25406 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4018  sulfite reductase subunit alpha  27.59 
 
 
599 aa  160  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.104123  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1770  molybdopterin oxidoreductase  33.03 
 
 
1394 aa  160  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0309544  normal  0.0148137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1346  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  29.83 
 
 
1395 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.635163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0653  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.61 
 
 
598 aa  160  8e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.988648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02609  sulfite reductase, alpha subunit, flavoprotein  27.78 
 
 
599 aa  160  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3066  sulfite reductase subunit alpha  27.78 
 
 
599 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.944096  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0827  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.26 
 
 
607 aa  160  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0948  sulfite reductase subunit alpha  27.78 
 
 
599 aa  160  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.404353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02572  hypothetical protein  27.78 
 
 
599 aa  160  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0924  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  27.59 
 
 
599 aa  159  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03589  sulfite reductase, alpha subunit (flavoprotein)  27.55 
 
 
608 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2892  sulfite reductase subunit alpha  27.59 
 
 
599 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3111  sulfite reductase subunit alpha  27.59 
 
 
599 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1892  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.02 
 
 
730 aa  157  6e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161647  normal  0.0178534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3527  sulfite reductase subunit alpha  28.62 
 
 
609 aa  156  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0810  sulfite reductase subunit alpha  28.18 
 
 
599 aa  155  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2427  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  30.22 
 
 
608 aa  155  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0858  sulfite reductase (NADPH) flavoprotein, alpha chain  29.95 
 
 
605 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0317  sulfite reductase (NADPH) alpha subunit  30.63 
 
 
1383 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>