45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0117 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  100 
 
 		 190 aa  390  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  83.68 
 
 		 216 aa  331  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0252  TetR family transcriptional regulator  82.11 
 
 		 212 aa  320  7e-87  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 195 aa  84.7  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 191 aa  84  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3605  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.02462e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3352  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000543998  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 239 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1358  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.824963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6005  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.695496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3099  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.806996 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 245 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  21.48 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 221 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 206 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 214 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 189 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 206 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 217 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 197 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 235 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 199 aa  41.2  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 206 aa  41.2  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 274 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 260 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>