21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1385 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1385  O-antigen polymerase  100 
 
 
843 aa  1678    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3989  O-antigen polymerase  51.12 
 
 
864 aa  709    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000845888 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  98.22 
 
 
843 aa  1649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1775  hypothetical protein  28.14 
 
 
713 aa  161  5e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.59489  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  33.73 
 
 
471 aa  59.3  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.98 
 
 
457 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  25.98 
 
 
457 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
594 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  26.6 
 
 
425 aa  50.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26.92 
 
 
461 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.15 
 
 
501 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.6 
 
 
464 aa  48.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  27.75 
 
 
594 aa  48.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  28.06 
 
 
438 aa  47.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  22.35 
 
 
737 aa  47.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.65 
 
 
632 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.53 
 
 
437 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  29.94 
 
 
435 aa  46.6  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0089  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
388 aa  45.8  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.159552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  26.29 
 
 
436 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  29.53 
 
 
467 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>