61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5188 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 423 aa  867    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  49.27 
 
 		 423 aa  402  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  39.64 
 
 		 979 aa  222  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  34.14 
 
 		 3172 aa  176  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.14 
 
 		 3301 aa  175  9.999999999999999e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3255  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.79 
 
 		 407 aa  153  5.9999999999999996e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175633  normal  0.26995 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2370  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.47 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0553875  normal  0.0113185 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  28.93 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3672  hypothetical protein  28.27 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.43765  normal  0.291983 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.95 
 
 		 381 aa  111  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  26.03 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  28.62 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.16 
 
 		 440 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.25 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1068  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  33.18 
 
 		 374 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6880  hypothetical protein  31.31 
 
 		 383 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.861416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  25.86 
 
 		 360 aa  95.5  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6825  hypothetical protein  28.79 
 
 		 400 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  29.5 
 
 		 366 aa  92.4  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  30.73 
 
 		 418 aa  88.2  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.99 
 
 		 366 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  52.81 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  27.94 
 
 		 374 aa  78.2  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.82 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.1 
 
 		 487 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3813  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.88 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6306  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.96 
 
 		 350 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.03 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.83 
 
 		 844 aa  70.5  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.35 
 
 		 595 aa  70.1  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.9 
 
 		 378 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.29 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.73 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4313  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.35 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.133022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.7 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0427  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 		 372 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182451  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4682  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  32.58 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.148471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  23.28 
 
 		 380 aa  67  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0449  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0344  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  27.44 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.422128  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.1 
 
 		 630 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.23 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  36.59 
 
 		 1213 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  26.49 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.7 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0705  hypothetical protein  24.58 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5945  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.11 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.146298 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  28.96 
 
 		 362 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28498  predicted protein  33.88 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_28422  predicted protein  33.88 
 
 		 306 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.52 
 
 		 505 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.62 
 
 		 338 aa  53.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.29 
 
 		 391 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.56 
 
 		 493 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02270  expressed protein  31.67 
 
 		 561 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.800826  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0991  hypothetical protein  32.77 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.569438  normal  0.641944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  28.24 
 
 		 509 aa  47  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48697  predicted protein  30.86 
 
 		 399 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06680  expressed protein  27.88 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.175779  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44326  predicted protein  25.75 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.524343  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06810  expressed protein  26.72 
 
 		 469 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0774906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>