More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2302 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2302  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 829 aa  1701    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.556709  normal  0.916479 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2137  DNA polymerase III, epsilon subunit  37.54 
 
 		 864 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0426  helicase, UvrD/REP/exonuclease family protein  31.54 
 
 		 870 aa  442  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0421  helicase/exonuclease  30.97 
 
 		 870 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.65 
 
 		 841 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  36.57 
 
 		 707 aa  248  3e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.41 
 
 		 751 aa  244  3e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  35.81 
 
 		 744 aa  244  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.18 
 
 		 751 aa  244  7e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0382  UvrD/REP helicase  33.6 
 
 		 812 aa  239  2e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.264262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.2 
 
 		 772 aa  238  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  34.74 
 
 		 678 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.16 
 
 		 742 aa  233  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.5 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  31.66 
 
 		 749 aa  230  6e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.67 
 
 		 715 aa  229  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.37 
 
 		 741 aa  229  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  35.44 
 
 		 742 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.88 
 
 		 741 aa  229  2e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  32.33 
 
 		 813 aa  229  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  32.96 
 
 		 666 aa  229  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 785 aa  228  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  34.51 
 
 		 678 aa  228  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.07 
 
 		 718 aa  228  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 678 aa  227  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  35.02 
 
 		 736 aa  227  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.56 
 
 		 729 aa  226  1e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.04 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.04 
 
 		 730 aa  226  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  33.65 
 
 		 787 aa  225  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  36.26 
 
 		 688 aa  225  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.64 
 
 		 737 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  33.85 
 
 		 678 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  34.36 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.51 
 
 		 755 aa  222  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.58 
 
 		 747 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.74 
 
 		 732 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  35.84 
 
 		 760 aa  222  3e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  35.67 
 
 		 759 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.33 
 
 		 780 aa  221  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  31.44 
 
 		 714 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.26 
 
 		 756 aa  220  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 747 aa  219  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  31.98 
 
 		 753 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  31.98 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 753 aa  220  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 747 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  33.49 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.56 
 
 		 694 aa  219  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.98 
 
 		 751 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.76 
 
 		 753 aa  219  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  34.73 
 
 		 762 aa  219  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  33.48 
 
 		 768 aa  217  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.03 
 
 		 725 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.98 
 
 		 858 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  32.48 
 
 		 657 aa  215  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  35.61 
 
 		 729 aa  215  2.9999999999999995e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  33.94 
 
 		 743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.35 
 
 		 837 aa  214  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.57 
 
 		 757 aa  214  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.26 
 
 		 763 aa  214  5.999999999999999e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.42 
 
 		 830 aa  214  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.48 
 
 		 775 aa  214  5.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  35.09 
 
 		 751 aa  214  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  30.05 
 
 		 845 aa  214  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  34.3 
 
 		 706 aa  213  7.999999999999999e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 769 aa  213  7.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 739 aa  214  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  33.56 
 
 		 739 aa  213  9e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  32.02 
 
 		 783 aa  213  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  34.31 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  33.92 
 
 		 817 aa  212  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 755 aa  212  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.24 
 
 		 766 aa  212  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  32.4 
 
 		 724 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.3 
 
 		 738 aa  211  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  32.43 
 
 		 731 aa  211  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097000000000001e-19 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.71 
 
 		 1023 aa  211  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.18 
 
 		 783 aa  211  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.24 
 
 		 758 aa  211  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  32.72 
 
 		 765 aa  211  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.62 
 
 		 672 aa  211  6e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 786 aa  211  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  32.3 
 
 		 738 aa  210  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  33.63 
 
 		 673 aa  210  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  33.03 
 
 		 783 aa  211  7e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  31.69 
 
 		 770 aa  210  9e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.41 
 
 		 762 aa  209  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  33.41 
 
 		 678 aa  209  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  34.2 
 
 		 715 aa  209  2e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  32.15 
 
 		 665 aa  209  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  32.02 
 
 		 732 aa  209  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  33.18 
 
 		 743 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  33.7 
 
 		 726 aa  209  2e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  32 
 
 		 849 aa  209  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4600  UvrD/REP helicase  31.9 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000134986  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  31.8 
 
 		 765 aa  207  6e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.96 
 
 		 659 aa  207  7e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>