More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3948 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3948  cold-shock DNA-binding domain protein  100 
 
 		 67 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5002  cold-shock DNA-binding domain protein  79.1 
 
 		 67 aa  115  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0802588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1892  cold-shock DNA-binding domain protein  74.63 
 
 		 67 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4713  cold-shock DNA-binding domain protein  73.13 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0172  cold-shock DNA-binding domain protein  73.85 
 
 		 67 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000163048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1131  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.294478 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1251  cold-shock DNA-binding domain protein  75 
 
 		 67 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791861  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1055  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  100  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.481948  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0252  cold-shock DNA-binding protein family protein  70.15 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.994476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0273  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0262  cold-shock DNA-binding domain protein  70.15 
 
 		 67 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0735  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 70 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0927  cold-shock protein, DNA-binding  67.69 
 
 		 70 aa  97.1  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650584  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3093  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.18 
 
 		 72 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.475725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1648  cold shock domain-contain protein  67.69 
 
 		 69 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0273  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  71.88 
 
 		 67 aa  96.7  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.355642 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5134  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.984065  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0290  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5764  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 170 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.008002 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5581  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2246  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.67 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000157436  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2622  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345453 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2689  cold-shock DNA-binding protein family protein  66.15 
 
 		 69 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000312687 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5798  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.66 
 
 		 67 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.992183 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0160  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03406  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0156  cold-shock DNA-binding domain protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3845  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.644384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4932  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.859989 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5227  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.18 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.54507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3973  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4276  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1522  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03357  hypothetical protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3757  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4052  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3877  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.76351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3929  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4033  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.661127  normal  0.575238 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1465  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.359616  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3970  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4386  cold-shock DNA-binding domain protein  69.23 
 
 		 67 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3864  major cold shock protein  70.77 
 
 		 70 aa  94.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6014  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94.7  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5852  cold-shock DNA-binding protein family protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000587256  normal  0.480668 
 
 
 
NC_011761  AFE_0590  cold-shock protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000832642  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0742  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.0000000000219995  unclonable  0.0000000000274746 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1464  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1909  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000083542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2545  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242015  decreased coverage  0.000000000715587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1500  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  66.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2883  cold-shock DNA-binding domain protein  66.15 
 
 		 69 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2053  cold-shock DNA-binding domain protein  63.08 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.203977  normal  0.0111256 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2520  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000000151269  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6028  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1189  cold shock protein CspE  65.62 
 
 		 69 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0988  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1045  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.396466  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2951  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.15288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2676  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000256327  unclonable  1.4308e-18 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0521  Cold-shock protein DNA-binding protein  62.69 
 
 		 79 aa  94  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.49245  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1049  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  94  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3366  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5095  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4409  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  67.69 
 
 		 67 aa  93.6  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6907  cold-shock DNA-binding domain protein  67.19 
 
 		 67 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.240211  normal  0.394944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0567  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.15 
 
 		 68 aa  93.6  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.0000000000101913  hitchhiker  0.000143899 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5230  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  61.19 
 
 		 67 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01731  hypothetical protein  62.69 
 
 		 68 aa  93.6  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0507  cold-shock DNA-binding domain protein  61.54 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.804223  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6765  cold-shock DNA-binding domain protein  65.67 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.929729  normal  0.307986 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2780  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000626517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3292  cold-shock DNA-binding domain protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0070619  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0175  cold-shock DNA-binding protein family protein  61.19 
 
 		 67 aa  93.2  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7382  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 67 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1740  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.183326  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1053  cold shock-like transcription regulator protein  65.62 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.470883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_5000  cold shock protein  65.67 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1388  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.18 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000202704  normal  0.239262 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1469  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 69 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0166  major cold shock protein  67.69 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2140  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.19 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000000648799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2596  cold-shock DNA-binding protein family protein  67.69 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0752  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  68.75 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000576972  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2963  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.711924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4117  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  62.69 
 
 		 67 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.327381  normal  0.21845 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1366  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.08 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3031  cold shock protein CspE  64.06 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.036334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3052  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1112  cold shock transcription regulator protein  65.62 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000000170415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3167  cold-shock DNA-binding domain protein  65.62 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493488  hitchhiker  0.00220171 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4023  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477592 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0761  cold-shock domain-contain protein  65.62 
 
 		 81 aa  91.7  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.00000000000025188  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3176  cold-shock DNA-binding protein family protein  62.69 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0798  cold-shock DNA-binding protein family protein  65.62 
 
 		 68 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000106482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4020  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.67 
 
 		 66 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000184454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2974  cold shock protein CspE  64.06 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0637761  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0641  cold-shock DNA-binding domain protein  61.19 
 
 		 67 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1858  cold shock protein CspE  64.06 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0644498  normal  0.32354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3261  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  64.62 
 
 		 69 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>