189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2405 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2405  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 68 aa  137  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  36.51 
 
 		 889 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  34.92 
 
 		 889 aa  54.7  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2583  Heavy metal transport/detoxification protein  36.21 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.130658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.82 
 
 		 70 aa  52  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0611  mercuric ion binding protein, putative  32.84 
 
 		 68 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.259599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 802 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 802 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  29.51 
 
 		 833 aa  51.6  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  29.69 
 
 		 805 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1546  cation transport ATPase  31.82 
 
 		 742 aa  51.2  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0951  putative metal-binding protein  30.88 
 
 		 68 aa  50.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1697  copper ion-binding  27.94 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000580158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 806 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 806 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  27.87 
 
 		 849 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  24.62 
 
 		 806 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  28.79 
 
 		 750 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0205  heavy metal translocating P-type ATPase  28.33 
 
 		 823 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1163  copper ion binding protein  30.3 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 802 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4327  heavy metal transport/detoxification protein  35.82 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000196109  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2021  copper-translocating P-type ATPase  31.03 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01260  copper/silver-translocating P-type ATPase  37.04 
 
 		 905 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  33.87 
 
 		 799 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1856  copper-translocating P-type ATPase  37.1 
 
 		 890 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1686  heavy metal translocating P-type ATPase  31.03 
 
 		 811 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2925  heavy metal translocating P-type ATPase  29.69 
 
 		 767 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  31.34 
 
 		 797 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 894 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0206  Heavy metal transport/detoxification protein  31.82 
 
 		 69 aa  48.5  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.855434  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  27.42 
 
 		 837 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  26.98 
 
 		 821 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0519  copper ion binding protein  25 
 
 		 67 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0689  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 694 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  34.92 
 
 		 954 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84044  copper-transporting ATPase (Cu(2+)-ATPase)  33.87 
 
 		 1196 aa  48.1  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  unclonable  0.00231928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 866 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04850  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 826 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000573179  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1149  copper ion binding protein  30.3 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  25.71 
 
 		 837 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  29.85 
 
 		 857 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2419  copper ion-binding  31.75 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000928484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2580  copper ion binding protein  28.57 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2634  copper ion binding protein  28.57 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6890  copper-translocating P-type ATPase  28.12 
 
 		 754 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 798 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 798 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0922  heavy metal translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 868 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  25.37 
 
 		 817 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  26.23 
 
 		 838 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6797  Heavy metal transport/detoxification protein  29.41 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2460  heavy metal translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 836 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00836136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0281  hypothetical protein  29.69 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0181  copper ion binding protein  29.69 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.248632  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1715  copper ion binding protein  31.82 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0879446  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0591  Heavy metal transport/detoxification protein  31.25 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3683  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 791 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00270096  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1809  copper ion binding protein  29.69 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.865359  normal  0.918649 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  24.59 
 
 		 885 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.43 
 
 		 818 aa  45.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24480  copper chaperone  31.75 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  25.86 
 
 		 837 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4522  heavy metal transport/detoxification protein  22.73 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5743  heavy metal transport/detoxification protein  32.79 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1556  heavy metal transport/detoxification protein  23.44 
 
 		 142 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3497  copper ion binding protein  35.82 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.148374  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  26.67 
 
 		 942 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2514  heavy metal translocating P-type ATPase  20.63 
 
 		 845 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.229137  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  29.23 
 
 		 752 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  36.36 
 
 		 815 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.87 
 
 		 794 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09570  copper chaperone  31.48 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.344611  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3058  copper-translocating P-type ATPase  26.47 
 
 		 740 aa  44.3  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0297  heavy metal translocating P-type ATPase  26.23 
 
 		 744 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0720  Heavy metal transport/detoxification protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178805 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3112  Heavy metal transport/detoxification protein  36.84 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.533336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2465  heavy metal translocating P-type ATPase  28.33 
 
 		 876 aa  44.3  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3114  cadmium-translocating P-type ATPase  27.87 
 
 		 926 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.869684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2170  copper-translocating P-type ATPase  25.37 
 
 		 831 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  27.27 
 
 		 799 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2052  copper-translocating P-type ATPase  23.88 
 
 		 837 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.02596e-23 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  25.81 
 
 		 807 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2132  heavy metal-binding protein, putative  28.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  28.57 
 
 		 794 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1003  heavy metal translocating P-type ATPase  28.12 
 
 		 807 aa  43.9  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  24.59 
 
 		 938 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9003  hypothetical protein  34.33 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  26.79 
 
 		 814 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1663  PBP/HMA domain-containing protein  24.59 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.140862  normal  0.759256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  26.87 
 
 		 797 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1097  copper ion binding protein  25.37 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0571836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  29.03 
 
 		 804 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  31.25 
 
 		 797 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>