More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1181 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1181  L-glutamine synthetase  100 
 
 		 451 aa  926    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3524  glutamate--putrescine ligase  64.53 
 
 		 444 aa  594  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.435958  normal  0.190458 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2416  glutamine synthetase catalytic region  49.44 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.175652 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0866  glutamate--putrescine ligase  49.21 
 
 		 445 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2019  glutamate--ammonia ligase  48.76 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0375  L-glutamine synthetase  48.76 
 
 		 445 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3702  glutamate--ammonia ligase  47.71 
 
 		 443 aa  411  1e-113  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.928007 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4677  glutamine synthetase family protein  44.06 
 
 		 456 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2336  glutamine synthetase catalytic region  44.92 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1127  L-glutamine synthetase  46.5 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.278504  normal  0.417665 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1836  L-glutamine synthetase  45.77 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.406794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0387  glutamine synthetase  43.67 
 
 		 458 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5184  glutamine synthetase, putative  44.01 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.92577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48880  glutamine synthetase  44.7 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03860  putative glutamine synthetase  43.89 
 
 		 458 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38140  putative glutamine synthetase  44.7 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0019966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0955  glutamine synthetase catalytic region  43.12 
 
 		 461 aa  379  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5244  glutamate--putrescine ligase  43.78 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.792573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3247  glutamine synthetase  44.24 
 
 		 458 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5299  glutamine synthetase, putative  44.06 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.802661  normal  0.238566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5091  glutamate--putrescine ligase  43.55 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0279  glutamate--putrescine ligase  43.32 
 
 		 458 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0546  glutamine synthetase, catalytic region  45.16 
 
 		 453 aa  376  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5347  glutamate--putrescine ligase  43.84 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5208  glutamate--putrescine ligase  43.84 
 
 		 460 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.179896  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5408  L-glutamine synthetase  42.86 
 
 		 458 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.532857  hitchhiker  0.00182517 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2068  glutamate--putrescine ligase  45.08 
 
 		 472 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5310  glutamine synthetase  42.86 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4868  glutamate--ammonia ligase  42.86 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2122  L-glutamine synthetase  42.99 
 
 		 458 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0668807  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0174  glutamate--putrescine ligase  44.06 
 
 		 460 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3216  glutamine synthetase catalytic region  44.8 
 
 		 472 aa  365  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0110604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0341  L-glutamine synthetase  42.92 
 
 		 459 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0727612  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2349  glutamine synthetase catalytic region  44.75 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.582872  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2328  glutamine synthetase catalytic region  44.75 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1825  glutamate--putrescine ligase  44.75 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0546478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1506  glutamate--putrescine ligase  44.75 
 
 		 472 aa  360  4e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1939  glutamate--putrescine ligase  44.75 
 
 		 472 aa  359  6e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.23252 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1412  glutamate--putrescine ligase  44.29 
 
 		 472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01274  gamma-Glu-putrescine synthase  44.29 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.798701  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1533  glutamate--putrescine ligase  44.52 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01285  hypothetical protein  44.29 
 
 		 472 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.904201  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2717  glutamine synthetase catalytic region  43.45 
 
 		 455 aa  350  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.648356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3952  glutamine synthetase catalytic region  41.36 
 
 		 459 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0296195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00464  gamma-glutamylputrescine synthetase  43.35 
 
 		 459 aa  349  5e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.446878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1118  glutamate--ammonia ligase  40.5 
 
 		 463 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.770456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0777  glutamine synthetase  42.86 
 
 		 456 aa  341  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1342  glutamate--putrescine ligase  42.99 
 
 		 459 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738876  normal  0.165008 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4547  glutamine synthetase, putative  42.76 
 
 		 454 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1568  L-glutamine synthetase  42.07 
 
 		 468 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.719328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0219  glutamine synthetase, catalytic region  41.84 
 
 		 464 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4054  glutamine synthetase catalytic region  42.53 
 
 		 454 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3842  glutamate--putrescine ligase  42.53 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3049  glutamine synthetase, catalytic region  41.38 
 
 		 464 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.486199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1174  glutamate--ammonia ligase  40.27 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.189992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72850  putative glutamine synthetase  41.42 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3764  hypothetical protein  43.22 
 
 		 454 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44240  putative glutamine synthetase  42.99 
 
 		 454 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6323  glutamine synthetase  41.42 
 
 		 455 aa  326  5e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1406  glutamine synthetase  39.91 
 
 		 451 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.483277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2143  L-glutamine synthetase  42.07 
 
 		 454 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4366  glutamine synthetase, catalytic region  41.84 
 
 		 471 aa  316  6e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4525  L-glutamine synthetase  39.59 
 
 		 455 aa  315  8e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0951  glutamine synthetase catalytic region  37.69 
 
 		 450 aa  310  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0584  glutamine synthetase catalytic region  39.12 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1100  Glutamate--putrescine ligase  38.72 
 
 		 458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.2027 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0887  glutamine synthetase catalytic region  40.6 
 
 		 459 aa  300  3e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3721  glutamine synthetase catalytic region  40.09 
 
 		 448 aa  292  7e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.504584  normal  0.0215831 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5090  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0342  L-glutamine synthetase  37.53 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03880  glutamine synthetase  36.87 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0389  glutamine synthetase  36.87 
 
 		 452 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5183  glutamine synthetase, putative  37.03 
 
 		 452 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5243  glutamate--putrescine ligase  37.03 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.689829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0280  glutamate--putrescine ligase  36.81 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5407  L-glutamine synthetase  37.75 
 
 		 452 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000279947 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0804  glutamine synthetase, catalytic region  39.41 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0418139  normal  0.144728 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4806  glutamine synthetase catalytic region  39.86 
 
 		 448 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3148  glutamine synthetase, putative  36.53 
 
 		 452 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2707  glutamate--putrescine ligase  36.75 
 
 		 452 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210959  normal  0.606055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3559  glutamine synthetase, catalytic region  38.32 
 
 		 448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.610228  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5309  glutamine synthetase  35.7 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2566  glutamate--putrescine ligase  36.53 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2897  glutamate--putrescine ligase  36.36 
 
 		 452 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1845  glutamine synthetase catalytic region  38.95 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.561959  hitchhiker  0.00870398 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4867  glutamate--ammonia ligase  35.7 
 
 		 452 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0918007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5385  glutamine synthetase catalytic region  38.95 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3465  glutamine synthetase, catalytic region  38.95 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1785  glutamine synthetase catalytic region  38.5 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4278  glutamine synthetase, catalytic region  39.64 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702735  normal  0.233785 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4901  glutamine synthetase, catalytic region  38.95 
 
 		 448 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.653152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2828  L-glutamine synthetase  37.11 
 
 		 468 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0728  glutamine synthetase catalytic domain  37.33 
 
 		 444 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0636  glutamine synthetase catalytic domain  37.76 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.961715  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2022  glutamine synthetase family protein  37.76 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2079  L-glutamine synthetase  39.28 
 
 		 454 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2178  glutamine synthetase, putative  37.81 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3572  glutamate--putrescine ligase  37.99 
 
 		 444 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.701465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2163  glutamate--ammonia ligase  38.22 
 
 		 445 aa  281  2e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699868  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3098  L-glutamine synthetase  36.16 
 
 		 451 aa  281  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000533566  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>