50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6525 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6525  hypothetical protein  100 
 
 		 241 aa  502  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.679921  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03580  polysaccharide biosynthesis protein  47.5 
 
 		 237 aa  228  7e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.789751  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0877  hypothetical protein  46.06 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1083  hypothetical protein  46.22 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00230373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3714  hypothetical protein  45.61 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0137  hypothetical protein  36.13 
 
 		 241 aa  171  9e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5874  hypothetical protein  33.76 
 
 		 245 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.650646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1688  hypothetical protein  33.09 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1227  polysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.750362  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1296  3'-5' exonuclease  27.8 
 
 		 273 aa  59.3  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1631  hypothetical protein  27.95 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000204525  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0469  large-conductance mechanosensitive channel  25.57 
 
 		 336 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000368758  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2349  putative 3'-5' exonuclease  26.03 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.948558  normal  0.0792646 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1115  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2235  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295108  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2197  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.450824  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0054  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.289194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1843  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2364  propable polB  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30419  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1353  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0220984  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2227  hypothetical protein  25.54 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2094  hypothetical protein  24.37 
 
 		 278 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1838  putative 3'-5' exonuclease  25.52 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376243  normal  0.478604 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2857  hypothetical protein  27.87 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.550879  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0345  hypothetical protein  24 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1274  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.349568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0379  hypothetical protein  23.73 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.011615 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1149  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 264 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.803914  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0781  polysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 310 aa  49.7  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0522762  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2114  hypothetical protein  24.79 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0931649  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0385  hypothetical protein  22.63 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000693475  unclonable  0.000000000422197 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0589  polysaccharide biosynthesis protein  23.53 
 
 		 264 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.92996  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1248  conserved hypothetical protein, putative polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.813451  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0549  hypothetical protein  26.21 
 
 		 275 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.215773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1800  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  24.2 
 
 		 262 aa  46.2  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1757  3'-5' exonuclease  23.55 
 
 		 258 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0971  hypothetical protein  24.17 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1454  3'-5' exonuclease  24.68 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133375  normal  0.401434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0963  3'-5' exonuclease  21.79 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.188043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1730  3'-5' exonuclease  23.14 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0609431  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1398  hypothetical protein  23.03 
 
 		 272 aa  45.1  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.54759  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5692  3'-5' exonuclease, PolB-like protein  26.07 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.224827  normal  0.358759 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0477  hypothetical protein  24.18 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1819  3'-5' exonuclease  21.1 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.538856  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6260  3'-5' exonuclease  21.1 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.329369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1288  propable PolB  23.5 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.671751  normal  0.251577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2217  hypothetical protein  23.73 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.392582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2768  hypothetical protein  34.02 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.941783 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1843  3'-5' exonuclease  24.27 
 
 		 258 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.931305  normal  0.0685914 
 
 
-
 
NC_002978  WD0744  hypothetical protein  23.17 
 
 		 273 aa  42  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.133036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>