167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4566 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  100 
 
 
398 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4804  acyltransferase 3  62.95 
 
 
370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3136  acyltransferase 3  62.78 
 
 
361 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.549415  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6655  acyltransferase 3  48.52 
 
 
378 aa  342  7e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1980  acyltransferase 3  39.42 
 
 
352 aa  233  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000357128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1748  acyltransferase  40.97 
 
 
346 aa  228  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0196433  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3387  acyltransferase 3  38.54 
 
 
376 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.676839  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  38.54 
 
 
393 aa  224  3e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5216  acyltransferase 3  36.96 
 
 
374 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0774273  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6638  acyltransferase 3  36.44 
 
 
370 aa  210  3e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0773  acyltransferase 3  36.7 
 
 
382 aa  204  2e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1632  acyltransferase 3  37.7 
 
 
377 aa  201  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.126193 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2034  acyltransferase 3  29.56 
 
 
372 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0544666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4545  acyltransferase 3  32.76 
 
 
358 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522497  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1775  acyltransferase 3  31.73 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.158557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6453  acyltransferase 3  31.21 
 
 
363 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.292089 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3624  acyltransferase 3  28.83 
 
 
389 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  normal  0.749773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4099  acyltransferase 3  29.1 
 
 
396 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.116738  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1695  acyltransferase 3  30.46 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353811  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  29.21 
 
 
360 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1348  acyltransferase 3  28.03 
 
 
366 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.558727  decreased coverage  0.000177044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2500  acyltransferase 3  29.64 
 
 
360 aa  95.5  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570615  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0303  acyltransferase 3  31.25 
 
 
368 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1939  acyltransferase 3  30.09 
 
 
341 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  27.67 
 
 
383 aa  79.7  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2783  acyltransferase 3  27.99 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0870608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0531  acyltransferase 3  29.77 
 
 
342 aa  72.8  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.6 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.6 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.6 
 
 
407 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2642  acyltransferase 3  32.8 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  28.76 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  28.05 
 
 
404 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0180  acyltransferase 3  26.44 
 
 
371 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470944  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  27.78 
 
 
478 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  26.91 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2379  acyltransferase-like protein  25.54 
 
 
353 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0602  acyltransferase 3  28.62 
 
 
366 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.361285  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3508  acyltransferase 3  35.35 
 
 
392 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  29.13 
 
 
346 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1913  acyltransferase 3  27.16 
 
 
356 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8167  acyltransferase 3  37.5 
 
 
415 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3098  acyltransferase 3  33.14 
 
 
372 aa  57.4  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  39.58 
 
 
393 aa  57.4  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4612  acyltransferase 3  26.56 
 
 
403 aa  57  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.67 
 
 
371 aa  56.6  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  38.55 
 
 
397 aa  56.2  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1252  acyltransferase 3  30.21 
 
 
673 aa  56.2  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  27.04 
 
 
353 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2824  acyltransferase 3  28.22 
 
 
598 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  30.26 
 
 
635 aa  53.9  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2288  acyltransferase 3  27.72 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  36.19 
 
 
684 aa  53.1  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2881  acyltransferase 3  36.28 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2653  hypothetical protein  34.07 
 
 
657 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  32.79 
 
 
368 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4291  acyltransferase 3  24.87 
 
 
380 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.625085  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  36.94 
 
 
359 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4836  acyltransferase 3  28.32 
 
 
383 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0543721 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2032  acyltransferase 3  26.17 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0585091  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0493  acyltransferase 3  26.77 
 
 
356 aa  52  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  31.73 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  34.07 
 
 
657 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  24.08 
 
 
333 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  31.47 
 
 
616 aa  50.8  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1006  acyltransferase 3  30.27 
 
 
366 aa  50.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  37.08 
 
 
584 aa  50.8  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  26.82 
 
 
378 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  30.61 
 
 
367 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  32.18 
 
 
603 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0330  acyltransferase 3  33.96 
 
 
397 aa  50.4  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.515323  normal  0.278208 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  29.56 
 
 
358 aa  50.1  0.00006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  27.39 
 
 
342 aa  50.1  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2970  acyltransferase 3  37.25 
 
 
528 aa  50.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1028  acyltransferase 3  43.9 
 
 
371 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  28.57 
 
 
656 aa  50.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  30.84 
 
 
353 aa  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  29.25 
 
 
352 aa  50.1  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1409  acyltransferase 3  39.47 
 
 
695 aa  49.7  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000344331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0673  acyltransferase 3  26.1 
 
 
354 aa  49.7  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  35.79 
 
 
690 aa  48.9  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  26.01 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  37.23 
 
 
660 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  32.65 
 
 
377 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3345  hypothetical protein  26.22 
 
 
363 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0124  acyltransferase 3  35.58 
 
 
393 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  32.76 
 
 
690 aa  48.5  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  27.32 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2353  acyltransferase 3  25.99 
 
 
389 aa  48.5  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  35.23 
 
 
354 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3475  acyltransferase 3  26.69 
 
 
356 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00730  acyltransferase, putative  34.52 
 
 
364 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2299  acyltransferase 3  26.58 
 
 
365 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1781  O-acyltransferase, putative  25.32 
 
 
362 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.957861  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  34.74 
 
 
607 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  25.94 
 
 
660 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3556  putative O-antigen acetylase  25.47 
 
 
658 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000981917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  35.29 
 
 
399 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00401  acyltransferase  34.82 
 
 
696 aa  47.4  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.8971  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2651  acyltransferase 3  24.2 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>