More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4410 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4410  phosphate binding protein  100 
 
 
277 aa  573  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0765558  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  37.64 
 
 
302 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  32 
 
 
270 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  29.84 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  29.84 
 
 
272 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  29.69 
 
 
272 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0979  phosphate binding protein  30.18 
 
 
302 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.113095 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  32.26 
 
 
274 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  30.53 
 
 
278 aa  119  6e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  31.5 
 
 
268 aa  117  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  33.08 
 
 
274 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  28.62 
 
 
284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  28.62 
 
 
274 aa  113  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28890  periplasmic phosphate binding protein  30.04 
 
 
428 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.938585  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1306  phosphate binding protein  32.14 
 
 
320 aa  107  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.259605 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  28.83 
 
 
273 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  30.9 
 
 
444 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  30.84 
 
 
330 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  29.77 
 
 
301 aa  103  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  30.5 
 
 
381 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  28.4 
 
 
272 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  28.32 
 
 
273 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3450  phosphate binding protein  29.85 
 
 
323 aa  99  7e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00138297  hitchhiker  0.000178512 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  28.68 
 
 
281 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  31.06 
 
 
451 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  22.74 
 
 
558 aa  97.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  27.41 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1908  OmpA/MotB domain protein  28.14 
 
 
519 aa  96.7  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.533887  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  26.06 
 
 
274 aa  96.3  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3157  phosphate binding protein  30.34 
 
 
321 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  25.69 
 
 
271 aa  95.9  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  30.47 
 
 
460 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  27.48 
 
 
281 aa  94  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  28.15 
 
 
482 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0618  phosphate binding protein  30.48 
 
 
321 aa  93.2  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  26.6 
 
 
270 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3301  phosphate binding protein  28.36 
 
 
323 aa  92.4  6e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212023  decreased coverage  0.0000000255714 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  26.07 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2747  phosphate binding protein  28.36 
 
 
323 aa  92.4  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000097067  hitchhiker  0.0000548451 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.31 
 
 
272 aa  92.4  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  27 
 
 
279 aa  92.4  7e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0179  phosphate binding protein  26.97 
 
 
322 aa  92  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  24.64 
 
 
273 aa  92  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  26.72 
 
 
281 aa  92  9e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  25.94 
 
 
285 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  27.51 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5487  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  27.72 
 
 
332 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  28.63 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  24.73 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2967  phosphate binding protein  27.99 
 
 
323 aa  90.5  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00749655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5041  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein, putative  27.34 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.503358 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5615  phosphate binding protein  26.97 
 
 
333 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.426736  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2553  phosphate binding protein  27.72 
 
 
323 aa  90.1  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0177722  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0220  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  29.5 
 
 
279 aa  89.7  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00000480634  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  26.62 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  28.33 
 
 
465 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  28.73 
 
 
271 aa  89.7  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  28.02 
 
 
276 aa  89  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  26.14 
 
 
277 aa  89  8e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3818  OmpA/MotB domain protein  27.51 
 
 
435 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0260085  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2475  OmpA/MotB  28.63 
 
 
447 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.201724  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2775  phosphate binding protein  27.68 
 
 
323 aa  88.2  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000207455  decreased coverage  0.000220712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3061  OmpA/MotB domain-containing protein  26.09 
 
 
435 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0939577  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  25.5 
 
 
277 aa  87.4  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2979  phosphate binding protein  26.77 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0450601  normal  0.0144524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  27.91 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2707  phosphate binding protein  27.68 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000109138  hitchhiker  0.00000175354 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1380  phosphate binding protein  26.77 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000270515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2877  phosphate binding protein  27.68 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000027974  hitchhiker  0.000116468 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1366  phosphate binding protein  26.77 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00814513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1405  phosphate binding protein  26.77 
 
 
323 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000717575  normal  0.051245 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0965  ompA family protein  24.48 
 
 
562 aa  86.7  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  26.35 
 
 
272 aa  86.7  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  27.04 
 
 
464 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  32.24 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2766  phosphate binding protein  27.82 
 
 
323 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00366631  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  30.23 
 
 
278 aa  85.9  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  26.07 
 
 
276 aa  85.9  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5329  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.34 
 
 
332 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0861464  hitchhiker  0.00379996 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1210  putative phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  27.41 
 
 
319 aa  85.9  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1951  OmpA/MotB domain-containing protein  26.64 
 
 
435 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  27.24 
 
 
272 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  26.25 
 
 
290 aa  85.5  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  27.8 
 
 
285 aa  85.5  9e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  27.63 
 
 
276 aa  85.5  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5237  phosphate binding protein  27.34 
 
 
332 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184797  normal  0.170384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0145  phosphate binding protein  27.34 
 
 
332 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.528128  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2653  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  27.41 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1076  phosphate-binding protein  27.88 
 
 
323 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000178631  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1560  phosphate-binding protein  26.94 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5376  phosphate binding protein  26.97 
 
 
332 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.572014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  26.64 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  24.19 
 
 
278 aa  84  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1298  phosphate binding protein  26.3 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000202068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2087  OmpA/MotB domain-containing protein  26.96 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70860  hypothetical protein  27.24 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.60906 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1450  phosphate binding protein  24.78 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.467901  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1479  phosphate binding protein  24.78 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.991618  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  26.59 
 
 
306 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6148  hypothetical protein  26.87 
 
 
323 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>