More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2208 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2208  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  100 
 
 
338 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1400  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  52.51 
 
 
346 aa  355  5e-97  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1144  alcohol dehydrogenase  51.5 
 
 
333 aa  348  8e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.257229  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3746  alcohol dehydrogenase  51.19 
 
 
343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2398  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  48.06 
 
 
333 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.732037  normal  0.947201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2347  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  48.66 
 
 
343 aa  328  6e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2391  zinc-binding alcohol dehydrogenase  49.1 
 
 
333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5216  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.46 
 
 
335 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00132977 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1449  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.6 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1475  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.6 
 
 
333 aa  314  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1375  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.46 
 
 
334 aa  313  1.9999999999999998e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5786  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  48.08 
 
 
339 aa  311  6.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00778522  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2982  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  47.49 
 
 
339 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3748  alcohol dehydrogenase  47.79 
 
 
339 aa  309  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3728  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  47.79 
 
 
339 aa  309  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4750  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.79 
 
 
339 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4816  oxidoreductase, zinc-binding dehydrogenase family  47.49 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140966  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4837  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.49 
 
 
339 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190992  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04135  predicted alcohol dehydrogenase, Zn-dependent and NAD(P)-binding  47.49 
 
 
339 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04099  hypothetical protein  47.49 
 
 
339 aa  308  8e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4525  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  47.49 
 
 
339 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0564298  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1292  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  46.31 
 
 
339 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3956  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  46.39 
 
 
334 aa  303  2.0000000000000002e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.762904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3652  alcohol dehydrogenase  46.31 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4871  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  303  4.0000000000000003e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0380128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4834  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  302  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809336  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4771  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  301  8.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.243247  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4741  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  301  9e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0435984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4890  hypothetical protein  46.31 
 
 
339 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.436401  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2975  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.27 
 
 
339 aa  299  5e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02580  zinc-containing alcohol dehydrogenase family protein  45.48 
 
 
333 aa  292  7e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.338069  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3359  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  45.59 
 
 
330 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0964587  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0345  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
347 aa  220  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253238  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0255  alcohol dehydrogenase  36.89 
 
 
347 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2575  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
347 aa  209  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198407  normal  0.37434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3275  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.89 
 
 
346 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30246  predicted protein  34.19 
 
 
358 aa  207  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1987  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  52.45 
 
 
214 aa  206  4e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.39 
 
 
335 aa  206  7e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19290  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  34.49 
 
 
348 aa  202  9e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8883  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
346 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2018  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.8 
 
 
348 aa  199  6e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3964  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  36.31 
 
 
348 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.454784  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0632  putative NADP-dependent alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  35.94 
 
 
352 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41988  predicted protein  37.28 
 
 
408 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.491145  normal  0.172268 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2974  alcohol dehydrogenase  34.44 
 
 
350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1689  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.16 
 
 
349 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458756  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0836  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  33.14 
 
 
351 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2206  zinc-binding alcohol dehydrogenase  34.57 
 
 
352 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00134118  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  34.77 
 
 
352 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3605  alcohol dehydrogenase  32.46 
 
 
348 aa  194  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2499  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  31.3 
 
 
348 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0546184  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3325  alcohol dehydrogenase  35.53 
 
 
350 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.696249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1992  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.14 
 
 
350 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0872348  normal  0.100769 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4474  alcohol dehydrogenase  34.87 
 
 
352 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000237059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1375  alcohol dehydrogenase  36.49 
 
 
351 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.61676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3348  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  31.9 
 
 
348 aa  193  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.596659  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5027  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.49 
 
 
344 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4586  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.66 
 
 
347 aa  192  9e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0208069  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4553  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.84 
 
 
348 aa  192  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2182  oxidoreductase, zinc-binding protein  35.14 
 
 
350 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3848  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.43 
 
 
350 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.12634  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2121  alcohol dehydrogenase  35.86 
 
 
359 aa  189  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5962  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10033  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34.97 
 
 
349 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.763939  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0114  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.17 
 
 
348 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.0906479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3048  alcohol dehydrogenase  35.24 
 
 
348 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3779  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  33.33 
 
 
348 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.167935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2709  D-isomer specific 2-hydroxyacid dehydrogenase family protein  33.81 
 
 
348 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6150  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.87 
 
 
351 aa  186  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2080  alcohol dehydrogenase  33.24 
 
 
348 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.266825  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4120  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  34 
 
 
350 aa  186  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal  0.906294 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3447  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3240  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2898  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.915177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0187  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.29 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2188  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0177  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  34.58 
 
 
354 aa  185  8e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154502  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3071  alcohol dehydrogenase  33.52 
 
 
350 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.989548  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0765  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  35.62 
 
 
354 aa  185  9e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442865  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3101  alcohol dehydrogenase  34.48 
 
 
350 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0372  NADP-dependent alcohol dehydrogenase  34.29 
 
 
354 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4279  alcohol dehydrogenase  33.43 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371426  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0972  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  34.58 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.119955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0846  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  34.58 
 
 
349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  33.03 
 
 
336 aa  183  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1694  alcohol dehydrogenase  32.85 
 
 
348 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1426  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  32.67 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2715  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  31.9 
 
 
351 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2756  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.92 
 
 
348 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.706145 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13061  NADP-dependent alcohol dehydrogenase adhC  32.37 
 
 
346 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0701661 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3159  alcohol dehydrogenase  33.91 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.146066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2431  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.43 
 
 
374 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4441  alcohol dehydrogenase  34.2 
 
 
350 aa  182  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.760934  normal  0.282889 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3042  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
350 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0360  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.81 
 
 
347 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912483  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2303  alcohol dehydrogenase  34.39 
 
 
348 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2490  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3120  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.895638 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3104  alcohol dehydrogenase  33.62 
 
 
350 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1817  alcohol dehydrogenase  35.28 
 
 
350 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.304058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>