42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2091 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1319    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  30.59 
 
 		 644 aa  286  8e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  40.11 
 
 		 364 aa  280  6e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  29.98 
 
 		 640 aa  263  6.999999999999999e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  24.26 
 
 		 587 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  23.38 
 
 		 584 aa  100  6e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  27.91 
 
 		 662 aa  55.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  30.4 
 
 		 651 aa  55.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  30.92 
 
 		 361 aa  53.5  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  29.25 
 
 		 609 aa  52.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  31.68 
 
 		 987 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  26.17 
 
 		 671 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  38.64 
 
 		 774 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  33.03 
 
 		 774 aa  50.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_432  predicted protein  42.86 
 
 		 829 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0880854  normal  0.487842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  27.43 
 
 		 673 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  30.61 
 
 		 994 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  26.67 
 
 		 997 aa  49.7  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  43.64 
 
 		 771 aa  49.3  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  24.85 
 
 		 667 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  29.36 
 
 		 738 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  43.14 
 
 		 648 aa  47.8  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  47.83 
 
 		 644 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  29.17 
 
 		 684 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  28.99 
 
 		 682 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  32.69 
 
 		 773 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  42.55 
 
 		 605 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  31.71 
 
 		 946 aa  46.6  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  36.63 
 
 		 674 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  22.7 
 
 		 702 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 		 605 aa  44.7  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  39.66 
 
 		 516 aa  44.3  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  32.81 
 
 		 682 aa  44.3  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  25.13 
 
 		 628 aa  44.3  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  42.22 
 
 		 622 aa  44.3  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0949  DNA mismatch repair protein MutL  32.31 
 
 		 611 aa  44.3  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  31.82 
 
 		 665 aa  44.3  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  31.88 
 
 		 589 aa  43.9  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0215  DNA mismatch repair protein MutL  35.29 
 
 		 600 aa  43.9  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0118368  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54331  mutl-like protein 1  40.38 
 
 		 695 aa  43.9  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.719113  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  29.47 
 
 		 756 aa  43.9  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  41.3 
 
 		 606 aa  43.9  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>