41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2069 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  895    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4171  hypothetical protein  68.19 
 
 		 438 aa  643    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0130561 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2228  hypothetical protein  66.36 
 
 		 437 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1221  hypothetical protein  40.79 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0215115  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0963  hypothetical protein  40.24 
 
 		 442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1524  hypothetical protein  38.28 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000521708 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0391  hypothetical protein  39.46 
 
 		 442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.762631  normal  0.486737 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1557  hypothetical protein  38.39 
 
 		 444 aa  320  1.9999999999999998e-86  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1077  hypothetical protein  40 
 
 		 446 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.044868  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0223  hypothetical protein  38.55 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.227803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2542  hypothetical protein  35.76 
 
 		 443 aa  305  7e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.15406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2001  hypothetical protein  35.46 
 
 		 443 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0214645  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0327  hypothetical protein  36.99 
 
 		 445 aa  298  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0190  hypothetical protein  35.66 
 
 		 448 aa  296  5e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4979  hypothetical protein  35.46 
 
 		 434 aa  295  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.941662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1168  hypothetical protein  35.41 
 
 		 436 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5415  hypothetical protein  34.45 
 
 		 441 aa  293  6e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.602565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3425  hypothetical protein  35.06 
 
 		 431 aa  291  1e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.220732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4430  hypothetical protein  35.39 
 
 		 431 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462016  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0140  hypothetical protein  35.38 
 
 		 432 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1246  hypothetical protein  34.59 
 
 		 449 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000280967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28830  hypothetical protein  34.2 
 
 		 431 aa  286  4e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000708644  decreased coverage  0.000000000585098 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5142  hypothetical protein  34.12 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.164057  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0062  hypothetical protein  35 
 
 		 443 aa  280  5e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2562  hypothetical protein  28.67 
 
 		 406 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00055451  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0075  putative ATP/GTP binding protein  25.25 
 
 		 435 aa  121  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.858141 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1205  methyl-accepting chemotaxis protein  25.19 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  hitchhiker  0.00000283136 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2147  putative ATP/GTP binding protein  24.81 
 
 		 435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.254333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0916  adenosylhomocysteinase  23.88 
 
 		 430 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3200  ATP/GTP binding protein  24.38 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.819514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1237  putative ATP/GTP binding protein  24.31 
 
 		 450 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0603  putative ATP/GTP binding protein  23.62 
 
 		 450 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4278  methyl-accepting chemotaxis protein  22.46 
 
 		 436 aa  89  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2956  putative ATP/GTP binding protein  20.9 
 
 		 442 aa  87  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0271039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1159  putative ATP/GTP binding protein  22.47 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05240  hypothetical protein  23.4 
 
 		 440 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0711  putative ATP/GTP binding protein  22.25 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0412472  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3078  putative ATP/GTP binding protein  22.38 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7837  methyl-accepting chemotaxis protein  24.06 
 
 		 464 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1495  methyl-accepting chemotaxis protein  21.38 
 
 		 441 aa  75.9  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3940  hypothetical protein  21.05 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>