More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2010 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2010  formiminoglutamase  100 
 
 
333 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.547952  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2645  formimidoylglutamase  43.34 
 
 
325 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0232342  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2879  formimidoylglutamase  42.59 
 
 
325 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2473  formimidoylglutamase  41.67 
 
 
325 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4072  formimidoylglutamase  41.99 
 
 
311 aa  220  3e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0764  formimidoylglutamase  37.81 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  38.12 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  42.27 
 
 
311 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0706  formimidoylglutamase  38.22 
 
 
344 aa  211  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.979825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2388  formimidoylglutamase  42.45 
 
 
315 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.770652  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0849  formimidoylglutamase  39.29 
 
 
358 aa  210  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0322036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2795  formimidoylglutamase  44.57 
 
 
315 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  42.27 
 
 
311 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  38.12 
 
 
345 aa  206  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  41.69 
 
 
348 aa  203  4e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2046  formimidoylglutamase  41.98 
 
 
322 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.55166  normal  0.477762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1031  formimidoylglutamase  39.71 
 
 
348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.454798  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5045  formimidoylglutamase  39.94 
 
 
329 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03130  probable arginase family protein  38.55 
 
 
334 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  42.25 
 
 
325 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  37.39 
 
 
336 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  38.35 
 
 
336 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2157  formiminoglutamase  40.96 
 
 
322 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1279  formiminoglutamase  36.47 
 
 
325 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30730  formiminoglutamase  41.18 
 
 
329 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4413  formimidoylglutamase  41.69 
 
 
320 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.624184 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0379  formimidoylglutamase  41.43 
 
 
323 aa  187  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1591  formimidoylglutamase  39.5 
 
 
316 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.854602  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1018  formiminoglutamase  37.46 
 
 
326 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0824  formimidoylglutamase  38.05 
 
 
313 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0915  formimidoylglutamase  38.05 
 
 
313 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0852  formimidoylglutamase  38.05 
 
 
313 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0883  formimidoylglutamase  38.05 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  40.57 
 
 
311 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1933  formimidoylglutamase  37.69 
 
 
363 aa  179  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.541509  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0938  formimidoylglutamase  37.74 
 
 
313 aa  178  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.62567 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1261  formimidoylglutamase  39.86 
 
 
312 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  38.96 
 
 
311 aa  175  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  38.96 
 
 
311 aa  175  8e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  38.55 
 
 
317 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.06 
 
 
316 aa  103  4e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1481  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.36 
 
 
267 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.354652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3336  formimidoylglutamase  26.48 
 
 
323 aa  93.6  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.301376  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4042  formiminoglutamase  30.86 
 
 
304 aa  93.2  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.954236  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3402  formimidoylglutamase  26.17 
 
 
323 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.786826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3439  formimidoylglutamase  25.62 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3709  formimidoylglutamase  25.62 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.545495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3659  formimidoylglutamase  25.62 
 
 
323 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3351  formimidoylglutamase  25.62 
 
 
323 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3757  formimidoylglutamase  25.86 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3682  formimidoylglutamase  26.17 
 
 
323 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0214303  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4106  formiminoglutamase  31.15 
 
 
332 aa  92  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  28.57 
 
 
478 aa  91.3  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3677  formimidoylglutamase  25.86 
 
 
323 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.707468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1559  formimidoylglutamase  25.86 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459006  normal  0.0875298 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.37 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2309  formimidoylglutamase  27.61 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.29 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3835  formiminoglutamase  29.09 
 
 
328 aa  86.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  27.24 
 
 
346 aa  86.3  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.09 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1806  agmatinase  29.75 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.885321  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4054  arginase  28.81 
 
 
304 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  26.04 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  29.39 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  26.09 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  26.09 
 
 
345 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  29.39 
 
 
365 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  26.09 
 
 
345 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4803  arginase  28.41 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0241  arginase  29.68 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  24.91 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0120  arginase  28.05 
 
 
319 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5671  putative agmatinase  27.54 
 
 
369 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5245  Agmatinase  24.48 
 
 
396 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.926572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0247  arginase  29.68 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.37133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0848  agmatinase  27.54 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.384974  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1820  agmatinase  30.91 
 
 
321 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4832  agmatinase  26.28 
 
 
378 aa  77.8  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  27.66 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3972  agmatinase  28.21 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2557  arginase  28.05 
 
 
310 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0841671  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2196  agmatinase  30.55 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  26.99 
 
 
356 aa  76.6  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4603  arginase  27.08 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3884  arginase  26.84 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  26.71 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0965  arginase  29.49 
 
 
341 aa  75.9  0.0000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  27.81 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0814  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.237989  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  23.88 
 
 
396 aa  75.5  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3541  agmatinase  30.18 
 
 
321 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  25.97 
 
 
305 aa  73.9  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  27.24 
 
 
333 aa  73.9  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  26.3 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  25.42 
 
 
293 aa  73.9  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  26.64 
 
 
318 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  28.72 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  29.41 
 
 
319 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  29.9 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>