253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1045 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1045  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  287  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4989  hypothetical protein  61.49 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0781809  normal  0.0109623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4729  hypothetical protein  57.72 
 
 		 149 aa  161  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1384  hypothetical protein  57.72 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.466954  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3404  hypothetical protein  57.33 
 
 		 153 aa  158  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432721 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06495  YqeY family protein  57.72 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1815  GatB/Yqey domain-containing protein  55.7 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.314895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0980  GatB/YqeY domain-containing protein  57.64 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.791367 
 
 
-
 
NC_002950  PG0585  YqeY family protein  51.05 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0684  hypothetical protein  50.71 
 
 		 513 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0596  hypothetical protein  49.66 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.776009 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0595  hypothetical protein  44.37 
 
 		 151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1727  hypothetical protein  47.37 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0694  hypothetical protein  45.7 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.179125  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0732  hypothetical protein  44.37 
 
 		 152 aa  112  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.932547 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1822  hypothetical protein  44.67 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04100  GatB/Yqey  46.31 
 
 		 148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0826  hypothetical protein  41.72 
 
 		 151 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0932  GatB/Yqey domain protein  41.72 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1302  GatB/YqeY domain-containing protein  41.22 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00024993  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1805  hypothetical protein  43.51 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1764  GatB/Yqey domain-containing protein  41.72 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1121  GatB/YqeY domain-containing protein  43.75 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0183323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6776  hypothetical protein  43.79 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.495884  normal  0.0146102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2822  hypothetical protein  43.79 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0270  hypothetical protein  40.52 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.267962 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2608  hypothetical protein  42.28 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.688199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1804  GatB/Yqey domain-containing protein  42.14 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.137443  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3034  GatB/Yqey domain-containing protein  40.91 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0112215  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2217  hypothetical protein  40.27 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0210  hypothetical protein  41.67 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119647  hitchhiker  0.00185458 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0240  GatB/Yqey domain-containing protein  39.74 
 
 		 149 aa  100  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0788  GatB/Yqey domain-containing protein  41.61 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0392  hypothetical protein  40 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2029  hypothetical protein  41.22 
 
 		 152 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0760  GatB/Yqey domain-containing protein  41.45 
 
 		 149 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2422  hypothetical protein  40.94 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0230  hypothetical protein  42.14 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000139051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2429  hypothetical protein  40.67 
 
 		 149 aa  97.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000704345  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0732  hypothetical protein  41.61 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6790  hypothetical protein  40.94 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0685695  normal  0.071478 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0238  hypothetical protein  39.07 
 
 		 149 aa  97.4  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1959  GatB/Yqey family protein  43.62 
 
 		 147 aa  97.4  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0325  hypothetical protein  46.05 
 
 		 147 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.469781 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4050  GatB/Yqey domain-containing protein  37.33 
 
 		 147 aa  95.9  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.961207  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2362  GatB/YqeY domain-containing protein  42.95 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2995  GatB/Yqey domain-containing protein  40.27 
 
 		 148 aa  94.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.16429  normal  0.53747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2281  hypothetical protein  40.54 
 
 		 147 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2964  hypothetical protein  40 
 
 		 151 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0326251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0619  GatB/Yqey family protein  42 
 
 		 148 aa  93.6  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3092  YqeY family protein  39.31 
 
 		 146 aa  93.2  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2682  hypothetical protein  42.67 
 
 		 148 aa  93.2  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1021  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2206  hypothetical protein  44 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0614  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.562126  normal  0.173232 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0625  GatB/YqeY  40.67 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2705  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4389  gatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4207  gatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4045  gatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4055  gatB/Yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0067  GatB/YqeY domain protein  39.57 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.222802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4533  gatb/yqey domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2886  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3285  hypothetical protein  40.51 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0359  GatB/Yqey domain-containing protein  37.84 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000661899  hitchhiker  0.000426433 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2518  GatB/Yqey domain-containing protein  38.67 
 
 		 152 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480425 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4815  GatB/YqeY domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.82393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4441  gatB/Yqey domain protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000157563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0809  gatB/Yqey domain protein  40.27 
 
 		 147 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0147844  decreased coverage  6.39338e-23 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2164  GatB/Yqey domain-containing protein  40.26 
 
 		 154 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4330  gatB/Yqey domain protein  39.6 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.571980000000001e-53 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4426  gatB/Yqey domain protein  40.27 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.103374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2308  hypothetical protein  39.86 
 
 		 147 aa  91.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1057  hypothetical protein  37.16 
 
 		 149 aa  92  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0962  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0158506 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1737  hypothetical protein  42.86 
 
 		 148 aa  91.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.46061  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0886  hypothetical protein  43.79 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.735291  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3943  hypothetical protein  43.71 
 
 		 148 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4159  GatB/YqeY domain-containing protein  39.6 
 
 		 147 aa  91.3  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3643  GatB/YqeY domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4140  hypothetical protein  38.51 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3884  GatB/Yqey domain-containing protein  42 
 
 		 148 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.771741  normal  0.422064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3792  GatB/Yqey domain protein  36.24 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2386  GatB/Yqey domain-containing protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0337  GatB/Yqey family protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0835  GatB/Yqey domain-containing protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2527  GatB/Yqey domain-containing protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.751518  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3541  GatB/YqeY domain-containing protein  41.61 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0584283  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0571  GatB/YqeY  38.93 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.100621  normal  0.254704 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3697  GatB/Yqey domain protein  36.24 
 
 		 147 aa  90.1  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0371  GatB/Yqey family protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1518  GatB/Yqey family protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1711  GatB/Yqey family protein  42.67 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0756  GatB/YqeY  37.66 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2386  hypothetical protein  40 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.69757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1214  hypothetical protein  40 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1247  hypothetical protein  36.84 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.427539  normal  0.989851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2870  hypothetical protein  41.89 
 
 		 151 aa  89  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0457502  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4285  GatB/YqeY domain-containing protein  45.71 
 
 		 173 aa  89  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0630803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>