242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0949 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0949  lipid A biosynthesis acyltransferase  100 
 
 
285 aa  595  1e-169  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2595  lipid A biosynthesis acyltransferase  40.42 
 
 
301 aa  227  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000162  normal  0.104426 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1078  lauroyl/myristoyl acyltransferase  36.69 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13223  putative lipd A biosynthesis related exported protein  34.51 
 
 
294 aa  194  2e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.743798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2621  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.81 
 
 
305 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.75947  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1368  lipid A biosynthesis acyltransferase  35.25 
 
 
290 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2222  acyltransferase  35.74 
 
 
305 aa  169  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000519053 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0480  hypothetical protein  35.56 
 
 
296 aa  169  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0299  lipid A biosynthesis acyltransferase  33.22 
 
 
288 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0692003  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4503  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.25 
 
 
291 aa  158  7e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4887  lipid A biosynthesis acyltransferase  32.27 
 
 
289 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231299  normal  0.44297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2172  lipid A biosynthesis acyltransferase  31.45 
 
 
293 aa  142  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.782883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0861  lipid A biosynthesis acyltransferase  29.45 
 
 
291 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652365  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5665  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.9 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5158  lipid A biosynthesis acyltransferase  30.43 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3019  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.57 
 
 
300 aa  106  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000114003  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1802  acyltransferase  26.94 
 
 
306 aa  101  2e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00482344 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0271  lipid A biosynthesis acyltransferase  27.48 
 
 
307 aa  96.3  5e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18900  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.61 
 
 
289 aa  95.5  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2698  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.68 
 
 
295 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.011241  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2612  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.9 
 
 
295 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0125544  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0343  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.31 
 
 
301 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2793  lipid A biosynthesis acyltransferase  28.24 
 
 
295 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2601  lipid A biosynthesis acyltransferase  25 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1445  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.91 
 
 
303 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1483  acyltransferase  23.78 
 
 
307 aa  82.8  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2346  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.09 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0480  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  25.52 
 
 
317 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.182596  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0376  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.17 
 
 
299 aa  81.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0899  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.91 
 
 
304 aa  80.1  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000435875 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0347  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.79 
 
 
298 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2295  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.21 
 
 
311 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1962  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.17 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.310079  decreased coverage  0.00642577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2579  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.5 
 
 
306 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225125  normal  0.0679615 
 
 
-
 
NC_002620  TC0278  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23 
 
 
453 aa  73.9  0.000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.609691  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0404  hypothetical protein  24.3 
 
 
281 aa  72  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0428  hypothetical protein  24.3 
 
 
281 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0281  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.67 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4183  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.5 
 
 
312 aa  68.9  0.00000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.796584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2901  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.66 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1862  lipid A biosynthesis acyltransferase  26.14 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0768  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.91 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.922594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1693  lipid A biosynthesis acyltransferase  21.6 
 
 
308 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3012  hypothetical protein  24.43 
 
 
278 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0369  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.07 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0495  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.36 
 
 
294 aa  65.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2123  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.59 
 
 
316 aa  65.1  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1103  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  25.28 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842223  normal  0.109296 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1749  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.43 
 
 
363 aa  64.3  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000789005  normal  0.147651 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1120  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.11 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0631  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.73 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0577087 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0655  acyltransferase  19.66 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.471805  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2343  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.19 
 
 
288 aa  64.3  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0623  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.46 
 
 
319 aa  63.5  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.791174  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3838  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.19 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2726  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.49 
 
 
301 aa  62.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598366  normal  0.0936253 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1563  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.61 
 
 
281 aa  62.4  0.000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0199  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.7 
 
 
297 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2358  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.28 
 
 
284 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0032  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.1 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2826  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.74 
 
 
306 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.459146  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0038  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.1 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.256445 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2521  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.39 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1567  lipid A biosynthesis acyltransferase  25.59 
 
 
363 aa  60.5  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000862302  normal  0.231532 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003629  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.13 
 
 
324 aa  60.8  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02482  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.5 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2280  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase (heat shock protein)  22.18 
 
 
307 aa  60.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0206  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.48 
 
 
286 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.323471  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1568  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  26.45 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.80937  normal  0.912268 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0207  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.67 
 
 
331 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000206716 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2076  lipid A biosynthesis acyltransferase  20.48 
 
 
313 aa  58.9  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4324  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.78 
 
 
325 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3066  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.37 
 
 
338 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2076  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal  0.965956 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1810  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.84 
 
 
306 aa  58.9  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0136  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.41 
 
 
297 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.8 
 
 
334 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0676516  normal  0.455658 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1257  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.44 
 
 
308 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.184329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01050  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.305601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1176  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2592  lipid A biosynthesis lauroyl (or palmitoleoyl) acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40292  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0308  lipid A biosynthesis acyltransferase  23.02 
 
 
322 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0190  lipid A biosynthesis acyltransferase  24.2 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1177  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1861  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.6 
 
 
340 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1433  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.728097  normal  0.116938 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2276  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2546  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.777293  normal  0.356214 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2993  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.76 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0374572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02612  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  24.91 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01058  hypothetical protein  23.59 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.315282  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1246  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.98 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.852941  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0655  lipid A biosynthesis palmitoleoyl acyltransferase  22.3 
 
 
307 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.603489  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2578  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.01 
 
 
297 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0074323 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0414  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.81 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122761 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0238  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  22.81 
 
 
302 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3518  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.74 
 
 
310 aa  56.6  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0224  lipid A biosynthesis acyltransferase  22.67 
 
 
331 aa  56.2  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0173  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  23.84 
 
 
294 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0154  lipid A biosynthesis lauroyl acyltransferase  21.33 
 
 
297 aa  56.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>