More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0811 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0811  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
323 aa  669    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00245375  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4067  protein of unknown function DUF323  48.19 
 
 
336 aa  310  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000050809  hitchhiker  0.0000128924 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4405  protein of unknown function DUF323  47.85 
 
 
334 aa  302  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.629157  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1133  protein of unknown function DUF323  50.93 
 
 
321 aa  301  9e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.316154  normal  0.911277 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  45.65 
 
 
359 aa  293  4e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0993  protein of unknown function DUF323  44.37 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1574  hypothetical protein  37.86 
 
 
587 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  36.82 
 
 
636 aa  134  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
637 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  35.27 
 
 
820 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  36.4 
 
 
882 aa  128  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  34.82 
 
 
925 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0607  hypothetical protein  37.61 
 
 
611 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  34.97 
 
 
433 aa  127  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  35.43 
 
 
586 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  34.63 
 
 
289 aa  125  8.000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  32.66 
 
 
325 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.87 
 
 
892 aa  125  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2747  hypothetical protein  37.45 
 
 
336 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000451907 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  34.12 
 
 
751 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  34.83 
 
 
826 aa  124  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  32.33 
 
 
617 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  32.6 
 
 
929 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  36.65 
 
 
293 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  37.61 
 
 
267 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  32.53 
 
 
1911 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3065  protein of unknown function DUF323  32.42 
 
 
1104 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.34453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  33.7 
 
 
358 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  34 
 
 
781 aa  119  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  32.88 
 
 
664 aa  119  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
740 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  34.04 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1864  protein of unknown function DUF323  35.29 
 
 
668 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1921  serine/threonine protein kinase  34.26 
 
 
715 aa  118  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.12165  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  33.88 
 
 
877 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  31.4 
 
 
802 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1675  hypothetical protein  34.21 
 
 
488 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.216639 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  34.72 
 
 
301 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1912  protein of unknown function DUF323  32.26 
 
 
346 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0442791 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  34.41 
 
 
267 aa  117  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  35.15 
 
 
603 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  31.46 
 
 
291 aa  116  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  33.76 
 
 
517 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003599  hypothetical protein  34.42 
 
 
262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.218262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  33.1 
 
 
284 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  36.92 
 
 
692 aa  115  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2485  putative cytoplasmic protein  31.68 
 
 
226 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.848357  normal  0.715845 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 
829 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2385  protein of unknown function DUF323  34.89 
 
 
263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  31.5 
 
 
292 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  31.79 
 
 
277 aa  114  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  33.86 
 
 
522 aa  114  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  32.63 
 
 
623 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  33.21 
 
 
593 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.45 
 
 
586 aa  113  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  32.97 
 
 
283 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1004  protein of unknown function DUF323  33.21 
 
 
298 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.302602  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0670  protein of unknown function DUF323  30.46 
 
 
654 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
538 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  32.96 
 
 
616 aa  112  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  35.15 
 
 
620 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  32.47 
 
 
287 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  31.9 
 
 
292 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2805  putative cytoplasmic protein  30.97 
 
 
226 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3216  hypothetical protein  32.37 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  32.34 
 
 
416 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  33.75 
 
 
625 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3542  hypothetical protein  32.85 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  29.71 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  30.56 
 
 
1196 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  32.92 
 
 
398 aa  110  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
269 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  32.16 
 
 
351 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2193  protein of unknown function DUF323  28.27 
 
 
453 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2826  hypothetical protein  34.76 
 
 
225 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00644344  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
637 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  31.27 
 
 
305 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0288  hypothetical protein  31.44 
 
 
922 aa  108  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.922716  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 
517 aa  106  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  28.26 
 
 
338 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2311  hypothetical protein  29.96 
 
 
224 aa  105  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.254882  normal  0.0358095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  32.58 
 
 
246 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3074  hypothetical protein  32.71 
 
 
620 aa  105  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
621 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  32.78 
 
 
618 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  35.05 
 
 
527 aa  104  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  33.46 
 
 
286 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  32.93 
 
 
535 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2601  hypothetical protein  31.15 
 
 
225 aa  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.683008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  34.04 
 
 
654 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  33.62 
 
 
657 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0757  protein of unknown function DUF323  32.2 
 
 
287 aa  102  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  31.3 
 
 
281 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  27.54 
 
 
584 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  32.71 
 
 
303 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2847  hypothetical cytosolic protein  29.89 
 
 
226 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0545564  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 
639 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  32.96 
 
 
862 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>