50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2633 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2633  flavodoxin  100 
 
 		 141 aa  293  5e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2171  ArsR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 297 aa  73.9  0.0000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1908  hypothetical protein  30.53 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0712  ArsR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0482  ArsR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.280132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1284  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201836  normal  0.37398 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2892  flavodoxin  27.34 
 
 		 173 aa  63.9  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3810  hypothetical protein  32.12 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0474372  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0447  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 		 489 aa  59.3  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1997  hypothetical protein  30.23 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000282274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1804  hypothetical protein  29.55 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348103  normal  0.0122545 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3000  hypothetical protein  30.95 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000872751  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1109  hypothetical protein  30.23 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000082959  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5572  hypothetical protein  22.83 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf870  flavodoxin  31.62 
 
 		 163 aa  52  0.000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2510  flavodoxin  28.79 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1855  hypothetical protein  25.26 
 
 		 191 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.250406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3791  flavodoxin  29.85 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6055  hypothetical protein  32.1 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113838 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1078  flavodoxin  30.65 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0279  flavodoxin  27.01 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1199  hypothetical protein  26.81 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.315921 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0781  hypothetical protein  30.08 
 
 		 230 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000507812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0391  putative flavodoxin  26.97 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  32.56 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5817  putative flavodoxin  25.58 
 
 		 175 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.117225 
 
 
-
 
NC_002950  PG1119  flavodoxin, putative  25.93 
 
 		 186 aa  45.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.78 
 
 		 428 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0519  flavodoxin  28.8 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18190  flavodoxin  24.81 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.568663  normal  0.949186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4431  hypothetical protein  20.66 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4564  hypothetical protein  20.66 
 
 		 176 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5938  putative flavodoxin  26.44 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0187  hypothetical protein  27.37 
 
 		 176 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0330126 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0351  pyruvate carboxyltransferase  26.05 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.63457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0214  putative flavodoxin  26.79 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.448936 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1418  putative flavodoxin  25 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1204  putative flavodoxin  28 
 
 		 164 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3236  putative flavodoxin  25.74 
 
 		 160 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  29.89 
 
 		 193 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1212  hypothetical protein  24 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189155  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1078  putative flavodoxin  22.9 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32510  flavodoxin protein  27.56 
 
 		 197 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.752902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1430  putative flavodoxin  28 
 
 		 164 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.89499  normal  0.109028 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2018  flavodoxin  25.83 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00576484  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  28.05 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  28.05 
 
 		 200 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4096  TrpR binding protein WrbA  28.4 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.832118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0944  hypothetical protein  27.16 
 
 		 158 aa  40  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.025785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>