More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0743 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0743  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
342 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4625  histidine kinase  51.27 
 
 
505 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2843  Osmosensitive K channel His kinase sensor  37.7 
 
 
926 aa  175  8e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1213  sensor histidine kinase KdpD  38.87 
 
 
900 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1586  histidine kinase  41.59 
 
 
473 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1680  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
961 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2273  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  38.19 
 
 
895 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3558  sensor histidine kinase  37 
 
 
512 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1171  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
356 aa  149  5e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001286  osmosensitive K+ channel histidine kinase KdpD  29.24 
 
 
344 aa  149  6e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3123  histidine kinase  30.57 
 
 
356 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
910 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
905 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1024  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.31 
 
 
1035 aa  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
905 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2503  two-component regulatory protein sensor kinase  33.61 
 
 
906 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
348 aa  136  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.230731  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
907 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1396  two-component system, sensor kinase protein KdpD  34.44 
 
 
993 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201035  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1253  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
993 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3249  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
944 aa  137  4e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894868  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1087  sensor protein KdpD  34.44 
 
 
954 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0780  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
954 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.795165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1245  sensor histidine kinase KdpD  34.44 
 
 
993 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.561584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1311  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
944 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.162113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2541  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
503 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2323  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
945 aa  136  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
901 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2201  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
945 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.394396  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1667  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
897 aa  135  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  30.99 
 
 
905 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2054  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
949 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.414922  normal  0.736885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
522 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5612  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
947 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0162151  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0464  sensor histidine kinase  32.16 
 
 
497 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  32.19 
 
 
885 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
888 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0665  osmosensitive K+ channel His kinase sensor  32.04 
 
 
907 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
902 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3078  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
886 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
890 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0993  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
951 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1245  sensor protein KdpD  34.04 
 
 
897 aa  129  6e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.011545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1215  sensor protein KdpD  32.55 
 
 
915 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.693772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10590  sensory histidine protein kinase  31.11 
 
 
488 aa  129  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
912 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0060  sensor histidine kinase  26.79 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
348 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000063575 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2930  sensor protein KdpD  34.57 
 
 
909 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.770189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
530 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  32.76 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  30.07 
 
 
905 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3764  histidine kinase  29.84 
 
 
545 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.285896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3579  sensor protein KdpD  32.62 
 
 
908 aa  127  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  31.14 
 
 
530 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4302  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
348 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.269088  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2695  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
897 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0787652  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4158  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
884 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.930921  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1156  sensor protein KdpD  32.62 
 
 
908 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.486498  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
348 aa  126  5e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327886 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1103  sensor protein KdpD  32.62 
 
 
908 aa  126  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0538967  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1710  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
884 aa  126  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3730  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
884 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04384  sensor protein KdpD  30.13 
 
 
886 aa  125  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0054  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
348 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
584 aa  125  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1885  sensor protein KdpD  31 
 
 
913 aa  125  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.899073  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4478  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 
356 aa  125  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000020806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3483  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
884 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1207  sensor protein KdpD  35.78 
 
 
895 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684772 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1127  sensor protein KdpD  32.94 
 
 
910 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2308  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
947 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3716  sensor protein KdpD  30.57 
 
 
914 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1673  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
947 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122182  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0056  histidine kinase  26.52 
 
 
348 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2285  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 
947 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0052  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
348 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1080  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
902 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.987638  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
902 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4547  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
907 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.657625 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
584 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0060  ATPase domain-containing protein  27.14 
 
 
348 aa  123  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000213269 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  33.19 
 
 
902 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
907 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
892 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 
541 aa  121  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0041  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
967 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.538382  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
889 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
695 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4239  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
894 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4030  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
883 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.706395 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
902 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
718 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1099  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
896 aa  120  3.9999999999999996e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3601  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
899 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1158  osmosensitive K+ channel Signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
897 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.75 
 
 
1021 aa  119  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1874  Osmosensitive K channel His kinase sensor  31.17 
 
 
895 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.743469  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24520  osmosensory K+channel histidine protein kinase, KdpD  29.31 
 
 
874 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.889371  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43350  two-component sensor KdpD  29.57 
 
 
885 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.619422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>