More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0985 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0985  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
331 aa  671    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107036  normal  0.0501032 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1492  ribose-phosphate pyrophosphokinase  89.91 
 
 
317 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.783372 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  86.38 
 
 
323 aa  567  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.83 
 
 
327 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1642  ribose-phosphate pyrophosphokinase  84.52 
 
 
323 aa  546  1e-154  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1155  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.28 
 
 
323 aa  541  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1674  ribose-phosphate pyrophosphokinase  83.75 
 
 
327 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  61.04 
 
 
316 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  59.05 
 
 
316 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.73 
 
 
316 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.62 
 
 
325 aa  359  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.19 
 
 
316 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.27 
 
 
314 aa  352  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.12 
 
 
316 aa  352  5e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.91 
 
 
314 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.42 
 
 
321 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
321 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
321 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.23 
 
 
321 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1474  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.21 
 
 
309 aa  348  6e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
314 aa  348  8e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.86 
 
 
309 aa  348  9e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  56.69 
 
 
327 aa  347  2e-94  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.56 
 
 
309 aa  345  7e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.19 
 
 
319 aa  345  8e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1471  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
309 aa  344  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.623247 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1446  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.03 
 
 
309 aa  343  2e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0807513  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.31 
 
 
314 aa  343  2e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1256  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.35 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.9 
 
 
316 aa  340  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.28 
 
 
322 aa  340  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
319 aa  340  2e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
330 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.31 
 
 
315 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
314 aa  339  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
313 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
330 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
329 aa  338  7e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.34 
 
 
318 aa  338  8e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
319 aa  338  9e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.31 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.16 
 
 
315 aa  335  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1015  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.52 
 
 
309 aa  335  9e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.72 
 
 
338 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.9 
 
 
308 aa  334  1e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.413607  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0996  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.05 
 
 
309 aa  334  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
311 aa  333  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1482  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.59 
 
 
328 aa  332  4e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00949997  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.13 
 
 
314 aa  332  4e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2097  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
313 aa  332  5e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1533  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
310 aa  332  5e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  54.98 
 
 
312 aa  332  5e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0925  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.72 
 
 
309 aa  332  5e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0148542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0896  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.4 
 
 
309 aa  332  7.000000000000001e-90  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00634031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.72 
 
 
314 aa  331  1e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.52 
 
 
331 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
316 aa  330  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2923  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.6 
 
 
313 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
315 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
317 aa  329  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3256  ribose-phosphate diphosphokinase  52.9 
 
 
313 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.670875  normal  0.0151507 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.81 
 
 
314 aa  329  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
332 aa  329  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4332  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
314 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0649453  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0174  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
310 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2165  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
310 aa  328  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0421  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.07 
 
 
314 aa  328  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3875  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
346 aa  328  7e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.175586  normal  0.0190503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.37 
 
 
315 aa  328  7e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4185  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
314 aa  328  7e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.849276  normal  0.673311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.09 
 
 
320 aa  327  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1817  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.1 
 
 
314 aa  328  1.0000000000000001e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.773652  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.6 
 
 
325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4133  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
318 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.266741  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.17 
 
 
315 aa  328  1.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1634  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.48 
 
 
310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.692153  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.05 
 
 
317 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  52.56 
 
 
321 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2257  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.95 
 
 
310 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441991  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2068  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
315 aa  326  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0476582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.63 
 
 
315 aa  326  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
315 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
315 aa  326  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.85 
 
 
315 aa  326  3e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.21 
 
 
320 aa  326  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2570  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00338227  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.98 
 
 
324 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0678  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.25 
 
 
311 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.585206  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0585  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.19 
 
 
318 aa  325  5e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.1 
 
 
359 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>