63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2587 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  78.8 
 
 
420 aa  662    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  100 
 
 
444 aa  892    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  58.99 
 
 
399 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  55.56 
 
 
419 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  54.87 
 
 
401 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  52.55 
 
 
402 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  51.95 
 
 
417 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  34.36 
 
 
399 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  31.11 
 
 
394 aa  186  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  29.58 
 
 
393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  33.07 
 
 
396 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  33.71 
 
 
408 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  28.98 
 
 
396 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  29.7 
 
 
431 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  31.82 
 
 
383 aa  162  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  26.91 
 
 
433 aa  144  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.76 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  30 
 
 
392 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  30.95 
 
 
428 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  29.97 
 
 
423 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  30 
 
 
388 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  29.05 
 
 
388 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  29.08 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  25.81 
 
 
412 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  28.8 
 
 
411 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  26.1 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  26.1 
 
 
412 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  26.1 
 
 
369 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  28.22 
 
 
414 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  27.72 
 
 
396 aa  89  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  29.06 
 
 
396 aa  86.7  8e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  28.99 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  28.41 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  25.91 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  28.76 
 
 
428 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  27.55 
 
 
438 aa  76.6  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  26.06 
 
 
399 aa  75.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  27.22 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  29.06 
 
 
400 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  27.33 
 
 
383 aa  73.9  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  26.18 
 
 
372 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  27.95 
 
 
422 aa  72  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  25.68 
 
 
385 aa  70.5  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  28.1 
 
 
400 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  25.81 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  26.91 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  32.19 
 
 
474 aa  66.2  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  27.42 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  26.61 
 
 
487 aa  64.7  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  24.59 
 
 
358 aa  62  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  26.57 
 
 
381 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  27.39 
 
 
443 aa  55.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  25.32 
 
 
477 aa  55.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  25.74 
 
 
411 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0173  methyltransferase  40 
 
 
203 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147272  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.65 
 
 
375 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  32.18 
 
 
189 aa  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
297 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  28.45 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  41.51 
 
 
583 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2754  methyltransferase, putative  36.56 
 
 
189 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2374  methyltransferase  36.56 
 
 
189 aa  43.5  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.1111  normal  0.0169548 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  25.74 
 
 
385 aa  43.1  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>