49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0802 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  910    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  58.46 
 
 		 487 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  37.75 
 
 		 385 aa  280  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  35.96 
 
 		 388 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  37.31 
 
 		 396 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  31.31 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  33.64 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  35 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  34.52 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  33.55 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  37.53 
 
 		 388 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  32.55 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  34.15 
 
 		 423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  30.9 
 
 		 412 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  33.99 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  33.96 
 
 		 428 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  37.38 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  32.2 
 
 		 418 aa  153  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  34.73 
 
 		 415 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  34.38 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  37.17 
 
 		 403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  30.16 
 
 		 438 aa  146  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  36.43 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  29.08 
 
 		 407 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  35.04 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  33.19 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  31.76 
 
 		 372 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  30.1 
 
 		 382 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  31.2 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  31.2 
 
 		 412 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  31.2 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  30.25 
 
 		 383 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  31.02 
 
 		 381 aa  89.7  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  27.12 
 
 		 399 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  31.08 
 
 		 416 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  29.81 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  31.25 
 
 		 474 aa  84.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  27.27 
 
 		 402 aa  83.6  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.34 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  26.08 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  25.59 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  24.79 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  20.17 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  22.02 
 
 		 399 aa  53.9  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  21.99 
 
 		 375 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  21.74 
 
 		 357 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  24.27 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  27.12 
 
 		 417 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  22.73 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>