27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4993 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  100 
 
 
408 aa  843    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  45.27 
 
 
396 aa  331  1e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  41.43 
 
 
399 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  38.7 
 
 
396 aa  279  6e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  37.8 
 
 
393 aa  278  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  38.21 
 
 
394 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  31.64 
 
 
433 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  35.24 
 
 
431 aa  233  3e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  34.49 
 
 
383 aa  216  7e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  34.84 
 
 
419 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  35.07 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  35.06 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  32.64 
 
 
402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  33.71 
 
 
444 aa  177  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  31.27 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  32.56 
 
 
401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  29.35 
 
 
417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  25.65 
 
 
400 aa  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  25 
 
 
414 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  30 
 
 
392 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  22.36 
 
 
383 aa  53.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  23.54 
 
 
399 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  24.06 
 
 
412 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  22.13 
 
 
422 aa  46.2  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  22.14 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  24.33 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  22.98 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>