55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2598 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  82.28 
 
 
414 aa  674    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  50 
 
 
400 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  51.55 
 
 
443 aa  356  3.9999999999999996e-97  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  50.12 
 
 
438 aa  353  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  50.75 
 
 
400 aa  350  4e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  48.65 
 
 
422 aa  335  5.999999999999999e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  48.9 
 
 
396 aa  332  9e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  48.58 
 
 
418 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  44.39 
 
 
412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  43.86 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  45.88 
 
 
415 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  41.09 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  40.67 
 
 
428 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  42.18 
 
 
423 aa  226  7e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  43.07 
 
 
428 aa  211  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  45.79 
 
 
403 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  41.19 
 
 
407 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  37.24 
 
 
392 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  38.12 
 
 
474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  43.42 
 
 
411 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  36.11 
 
 
396 aa  172  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  33.51 
 
 
385 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  35.06 
 
 
487 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  34.46 
 
 
477 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  34.75 
 
 
383 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  34.9 
 
 
382 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  34.75 
 
 
372 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  31.98 
 
 
416 aa  126  8.000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  30.95 
 
 
399 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  34.1 
 
 
412 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  34.1 
 
 
412 aa  116  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  33.62 
 
 
369 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  27.01 
 
 
407 aa  113  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  35.01 
 
 
399 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  31.55 
 
 
381 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  31.35 
 
 
358 aa  100  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  28.61 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  25.81 
 
 
402 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.8 
 
 
444 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.44 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  24.42 
 
 
399 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  28.12 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  22.01 
 
 
357 aa  66.6  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.21 
 
 
396 aa  63.5  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24.01 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  20.22 
 
 
393 aa  60.1  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  22.35 
 
 
385 aa  57.8  0.0000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  24.71 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.86 
 
 
396 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  25.07 
 
 
431 aa  55.5  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  22.98 
 
 
394 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  22.84 
 
 
383 aa  49.7  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2918  Methyltransferase type 11  32.56 
 
 
264 aa  47.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00373911 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6175  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  38.57 
 
 
294 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.345361  normal  0.178863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>