54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3060 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  778    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  62.75 
 
 
400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  56.46 
 
 
438 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  56.35 
 
 
418 aa  419  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  51.4 
 
 
414 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  54.91 
 
 
422 aa  356  3.9999999999999996e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  50.75 
 
 
411 aa  350  4e-95  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  48.84 
 
 
412 aa  322  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  52.64 
 
 
396 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  47.65 
 
 
388 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  44.29 
 
 
423 aa  250  3e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  45.2 
 
 
388 aa  243  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  47.74 
 
 
428 aa  225  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  47.26 
 
 
403 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  44.58 
 
 
415 aa  223  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  40.52 
 
 
428 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  43 
 
 
443 aa  212  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  40.62 
 
 
407 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  47.72 
 
 
411 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  36.63 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  38.92 
 
 
396 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  37.99 
 
 
474 aa  176  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  34.52 
 
 
477 aa  153  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  34.8 
 
 
487 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  38.68 
 
 
382 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  32.09 
 
 
385 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  37.17 
 
 
383 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  33.98 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  30.89 
 
 
407 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  36.09 
 
 
372 aa  125  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  35.4 
 
 
416 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  33.16 
 
 
399 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  35.4 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  34.72 
 
 
358 aa  110  6e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  33.92 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  33.92 
 
 
412 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  33.92 
 
 
369 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  31.14 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.88 
 
 
399 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  26.84 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  30.27 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  25.79 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  28.77 
 
 
417 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  22.47 
 
 
385 aa  70.1  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.1 
 
 
444 aa  69.7  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  25.31 
 
 
357 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  26.97 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.72 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  26.6 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  21.41 
 
 
396 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  26.57 
 
 
431 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2419  hypothetical protein  29.5 
 
 
212 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  25.13 
 
 
396 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2298  hypothetical protein  28.78 
 
 
212 aa  44.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>