56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_2063 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  100 
 
 
417 aa  835    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  52.87 
 
 
420 aa  412  1e-114  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  51.95 
 
 
444 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  48.99 
 
 
399 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  46.9 
 
 
419 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  50.77 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  47.12 
 
 
402 aa  332  5e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  32.63 
 
 
399 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  32.03 
 
 
396 aa  164  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  27.7 
 
 
396 aa  162  8.000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  29.95 
 
 
394 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  29.35 
 
 
408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4599  hypothetical protein  25.91 
 
 
393 aa  156  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1929  hypothetical protein  30.37 
 
 
383 aa  152  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0557173  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  29.26 
 
 
431 aa  147  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0026  hypothetical protein  25.06 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  28.38 
 
 
407 aa  119  7e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  27.78 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  28.16 
 
 
399 aa  93.6  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  30.45 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  30.45 
 
 
412 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  30.45 
 
 
369 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  29.68 
 
 
383 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  28.16 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  29.62 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  27.58 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  27.05 
 
 
372 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  25.3 
 
 
392 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  26.93 
 
 
428 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  28.77 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  26.83 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  23.88 
 
 
412 aa  75.5  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  24.87 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  24.93 
 
 
438 aa  73.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  26.38 
 
 
358 aa  70.1  0.00000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  26.78 
 
 
400 aa  69.7  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  27.14 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  26.29 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  25.36 
 
 
407 aa  68.9  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  25 
 
 
423 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  24.71 
 
 
411 aa  64.7  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  26.18 
 
 
422 aa  63.5  0.000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  24.8 
 
 
388 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  25.91 
 
 
385 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  27.4 
 
 
487 aa  62  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  25.59 
 
 
381 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  24.1 
 
 
382 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  28.29 
 
 
415 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  24.84 
 
 
375 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  32.04 
 
 
443 aa  49.3  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  27.3 
 
 
428 aa  47.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1488  protein of unknown function DUF548  29.71 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.763853  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3981  putative methyltransferase  25.64 
 
 
209 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0470106  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  26.28 
 
 
403 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  27 
 
 
297 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0116  methyltransferase  32.35 
 
 
189 aa  43.1  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>