60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1085 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1085  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  781    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.643719  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1152  hypothetical protein  49.75 
 
 
388 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3843  hypothetical protein  54.4 
 
 
428 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0734  hypothetical protein  48.25 
 
 
396 aa  291  2e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.386022  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0682  hypothetical protein  47.1 
 
 
418 aa  285  7e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2590  hypothetical protein  49.73 
 
 
400 aa  283  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.709956  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3648  hypothetical protein  50.68 
 
 
388 aa  277  3e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29160  hypothetical protein  46.19 
 
 
438 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3060  hypothetical protein  47.28 
 
 
400 aa  265  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.849253  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0634  hypothetical protein  41.65 
 
 
412 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2600  hypothetical protein  44.82 
 
 
423 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.590151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4259  hypothetical protein  48.64 
 
 
415 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4233  hypothetical protein  53.66 
 
 
411 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.118857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0077  hypothetical protein  41.28 
 
 
392 aa  257  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4027  hypothetical protein  43.29 
 
 
428 aa  256  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2888  hypothetical protein  43.41 
 
 
414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00389281  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2598  hypothetical protein  45.48 
 
 
411 aa  250  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000882332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4454  hypothetical protein  43.82 
 
 
407 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08510  hypothetical protein  41.63 
 
 
422 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1663  hypothetical protein  42.39 
 
 
396 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16610  hypothetical protein  42.24 
 
 
443 aa  190  2.9999999999999997e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0971  hypothetical protein  33.42 
 
 
385 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0802  hypothetical protein  37.77 
 
 
477 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4268  hypothetical protein  39.15 
 
 
372 aa  157  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.945024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2091  hypothetical protein  38.87 
 
 
381 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2934  hypothetical protein  36.87 
 
 
382 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5789  hypothetical protein  36.05 
 
 
487 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.712723  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3266  hypothetical protein  34.96 
 
 
399 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07540  hypothetical protein  33.57 
 
 
474 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.559975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3087  hypothetical protein  37.22 
 
 
416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000449393  hitchhiker  0.0000364534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1907  hypothetical protein  36.9 
 
 
412 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1860  hypothetical protein  36.9 
 
 
412 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.181101  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1841  hypothetical protein  37.39 
 
 
369 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6063  hypothetical protein  36 
 
 
383 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28440  hypothetical protein  34.74 
 
 
399 aa  132  9e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2351  hypothetical protein  31.98 
 
 
407 aa  125  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.175675  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13053  hypothetical protein  31.86 
 
 
358 aa  108  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.150174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 
385 aa  84.3  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2452  hypothetical protein  24.79 
 
 
402 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.280378  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0021  hypothetical protein  26.52 
 
 
399 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0629415  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2822  hypothetical protein  26.75 
 
 
420 aa  79.7  0.00000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2446  methyltransferase  24.36 
 
 
357 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.949706  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2423  hypothetical protein  26.8 
 
 
419 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2182  hypothetical protein  27.17 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2587  hypothetical protein  28.09 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13168  hypothetical protein  22.14 
 
 
396 aa  72.8  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1360  hypothetical protein  23.99 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1098  hypothetical protein  23.63 
 
 
407 aa  59.7  0.00000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.697484 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2063  hypothetical protein  27.58 
 
 
417 aa  53.5  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3389  hypothetical protein  23.26 
 
 
399 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.121637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0324  SAM-dependent methyltransferase  25.48 
 
 
431 aa  51.2  0.00004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.71025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4993  hypothetical protein  26.3 
 
 
408 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.513988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2262  hypothetical protein  26.18 
 
 
396 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237582  normal  0.287603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.37 
 
 
250 aa  47.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0828  methyltransferase small  39.44 
 
 
414 aa  46.6  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.267294  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2926  hypothetical protein  24.7 
 
 
394 aa  45.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.812191  hitchhiker  0.000139992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1032  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  37.97 
 
 
443 aa  45.8  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0127983  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0642  HemK family modification methylase  37.86 
 
 
294 aa  45.1  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.179675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0573  50S ribosomal protein L11P methyltransferase  36.19 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1340  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.89 
 
 
465 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.308627 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>